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1. 分子结构及表示
2. 同分异构
3. 顺反异构及标识
4. 对映异构与标识
5. 分子的模型表示
分子结构的基本知识
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分子结构是指一个分子的组成原子(基团)通过价键连接和空间排列所形成的几何形象
分子结构 = 价键连接方式 + 空间排列方式
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1. 分子结构及表示
2. 同分异构
3. 顺反异构及标识
4. 对映异构与标识
5. 分子的模型表示
分子结构的基本知识
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决定分子几何形象的因素
1. 组成原子(基团)的性质和数量有关系
2. 同分异构(Isomerism)
(1)原子(基团)间的连接方式(Constitution,构造方式)不同,不同构造方式产生构造异构;
(2)在构造方式一定的情况下,由价键在空间的排列方式所规定的原子(基团)在空间的排列方式称为构型(Configuration ) ,不同的构型产生构型异构;
(3)在构造或构型一定的情况下,由单键的旋转引起的单键相连基团在空间的各种排列方式称为构象(Conformation),不同的构象产生构象异构;
(4)上述三个因素不一定同时存在。
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重要说明
构型: 分子中由于各原子或基团间特有的固定的空间排列方式; 一种构型转变成另一种构型则要求共价键的断裂、原子(基团)间的重排和新共价键的重新形成。
构象: 指具有相同构造和构型的分子中,由于某个基团绕单键自由旋转而形成的不同的空间几何形象;在各种构象形式中,势能最低、最稳定的构象成为优势构象。
构象异构对小分子的性质和功能影响可以忽略,但构象的变化对于生物大分子的性质和功能则具有非常显著的影响;因此,当我们在谈论某个具体小分子的结构时,主要是指它的构造结构或构型结构。
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1. 分子结构及表示
2. 同分异构
3. 顺反异构及标识
4. 对映异构与标识
5. 分子的模型表示
分子结构的基本知识
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顺反异构(cis-trans isomerism)是由于双键或环结构上的单键不能旋转而产生的一种构型异构。在生物体的物质中,涉及顺反异构的主要是含有双键的不饱和脂肪酸。
(1)当C1(或C2)连接的两个基团相同时,无论C2(或C1)连接的两个基团是否相同,都不会产生同分异构体;
顺反异构的标识
(2)当C1和C2各自连接的两个基团不同,且C1连接的基团和C2连接的基团有一对相同或两对相同时,相同的基团在双键的同侧称为顺式(cis)构型,反之则称为反式(trans)构型(Cis和trans为拉丁语,分别表示同侧和对侧之意);
(3)当C1和C2连接的基团全部不同时,cis/trans定义失效,用Z/E构型标识法,即按照CIP规则将四个基团进行大小排序,两个较大的基团在双键的同侧标记为Z构型,Z为德语zusammen(在一起)的首字母,反之标记为E构型,E为德语entgegen(在对面)的首字母;
CIP(Cahn–Ingold–Prelog)规则:基团大小先按原子序数排大小(同位素按质量数排大小),原子序数相同时按与此原子相连的其他原子的原子序数排大小,依次类推,直至排出基团顺序;基团中有双键或三键时,等同于连接两个或三个相同的原子。
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(4)Z/E标识方法弥补了cis/trans标识方法的不足,有时两种标识完全对应,如下图左列;有时两种标识正好相反,如下图右列。
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1. 分子结构及表示
2. 同分异构
3. 顺反异构及标识
4. 对映异构与标识
5. 分子的模型表示
分子结构的基本知识
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光 (电磁波) 是横波
电场矢量E, 磁场矢量B, 偏振面YZ,波长 ?=OA,波数?=1/?,频率 f=1/T,波速c = f ?
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自然光与平面偏振光
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旋光现象的发现
1815年,毕奥(Jean Baptiste Biot)发现有些石英结晶将偏振光向右旋,有些将偏振光向左旋, 有些有机化合物(如葡萄糖、尼古丁、蔗糖等)也具有旋光性。
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1848年,Louis Pasteur在一个冷天成功从酒石酸铵钠的溶液中长出两种形状呈镜像对称的晶体,送给Biot检测,结果分别具有左、右旋光性。
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Louis Pasteur进一步认为,旋光性相反的酒石酸(铵钠),一定象它们的晶体互为镜像一样,也是互为镜像的两种不同结构,但具体是什么样,并没有答案。
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1874年,Vant Hof和Le.Bel提出,如果一个C原子连有四个不同基团,这四个基团在C原子周围可以有两种不同的排列形式,有两种不同的四面体空间构型,它们互为镜象,和左右手之间的关系一样,外形相似,但不能重合,此为手性。
Why?Chirality!
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Chirality ? Enantiomer ? Optical Isomer
手性 ? 对映异构体 ? 旋光异构体
手性中
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