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第二章 酶反应的基本原理 提要: 一、酶的组成及其结构特点 二、酶的催化作用机理 三、酶的类型及命名 四、影响酶催化反应的因素 一、酶基本知识 1.酶的概念 酶: 生活细胞产生的具有特殊空间构像的,能进行生物催化作用的生物大分子,包括蛋白质和核酸两类物质,其中以蛋白质为主。 (1)酶与一般催化剂的共性 用量少,催化效率高 不改变反应平衡点 可降低反应活化能 (2)酶的特性 高效性:以酶的转换数Kcat表示,mol底物/mol酶.min 酶的Kcat为103-107 mol底物/mol酶.min,比非酶催化效率高107-1013 倍。 专一性:结构专一性(相对专一性/绝对专一性) 立体异构专一性(几何异构/旋光异构) 温和性(不稳定性):酶催化需要的活化能低,生物大分子,结构稳固性差。 可调控性:底物浓度、温度、pH、抑制剂和激活剂等。 2、酶的聚集方式 (1)松散排列 酶在细胞中各自以可溶的单体形式存在,彼此没有结构上的联系。 反应时酶是随机扩散,催化效率不高。(如糖酵解历程) (2)簇式排列 几种酶有机地聚集在一起,镶嵌成一定的结构,形成多酶复合体。催化效率高。 (如丙酮酸脱氢酶复合体、脂肪酸合成酶、纤维素酶复合体) (3)与生物膜结合 一种结构更高的多酶复合体,酶整齐的排列在生物膜上。催化效率最高。(如呼吸链) 5、酶的活性基团及活性中心 活性中心:结合部位和催化部位 部分酶活性中心的氨基酸残基 酶 残基总数 活性中心残基 牛胰核糖核酸酶 124 His12, His119, Lys41 溶菌酶 129 Asp52, Glu35 牛胰凝乳蛋白酶 245 His57, Asp102,Ser195 牛胰蛋白酶 238 His46, Asp90, Ser183 木瓜蛋白酶 212 Cys25, His159 弹性蛋白酶 240 His45, Asp93, Ser188 枯草杆菌蛋白酶 275 His46, Ser221 碳酸酐酶 258 His93-Zn-His95 His117 二、酶的催化作用机理 1、中间产物学说 4、底物分子的形变与扭曲张力学说(strain) (1)酶受底物诱导发生构象改变,特别是活性中心的功能基团发生的位移或改向,呈现一种高活性功能状态。(2)酶活性中心的某些基团或金属离子可改变底物敏感健的电子云分布,产生“电子张力”而易于断裂,也可使底物的构象改变,接近过渡态 而易于反应,这就是张力()学说。 羧肽酶A和溶菌酶的X线衍射分析证明了张力效应是酶催化的机制之一。 5、多元催化 (multielement catalysis) 多元催化:多个基元催化形式的协同作用。一般包括酸-碱催化,共价催化(亲核催化, 亲电子催化)等。如凝乳蛋白酶:Ser-195亲核催化, His-57碱催化等; 酸-碱催化:通过暂时提供(或接受)一个质子以稳定过渡态达到催化反应的目的; 影响酶促反应速度的因素 底物浓度[S] 酶浓度[E] 反应温度 pH 值 抑制剂 激活剂 (1)米氏方程(Michaelis-Menten equation) 米氏常数Km的测定: 例题 D-丝氨酸脱水酶需要磷酸吡哆醛作为辅酶。催化反应: CH2OH · CHNH2 · COOH ? CH3CO · COOH+NH3 在实验中测定酶的磷酸吡哆醛饱和曲线得到下列数据: [s] v 磷酸吡哆醛?10 -5(M) 20分钟生成丙酮酸(?M) 0.20 0.150 0.40
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