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基因的力量:一次北欧生命科学考察
博物馆中的进化论
丹麦首都哥本哈根最著名的景点就是看海边的美人鱼像。但是有另外一个地方,常常被忽略,却能令人大开眼界。这就是丹麦的自然历史博物馆。这座博物馆包括了三个分馆:动物博物馆、地质博物馆和植物博物馆。最有特色、藏品最出众的,当属动物博物馆。
动物博物馆的中心是一副巨型的梁龙骨架,它有17米长,超过10米高,是世界上保存最完整的6具恐龙化石之一,其40%的骨架都是由原始化石组成。这个比例在所有博物馆藏品中是最高的。2009年,古生物学家莱蒙德的儿子,在美国怀俄明州的采石场发现了此具梁龙骨架。骨架被挖掘出之后在鹿特丹被修复组合,并进入拍卖市场。丹麦自然历史博物馆以超过650万美元的巨资买了下来,成为博物馆的标志性展品。 哥本哈根自然历史博物馆的工作人员在安装鲸骨架,这头鲸长14米,体重超过30吨
博物馆的另一大特色是对鲸骨骼标本的收藏。丹麦地处北欧门户,世界第一大岛――格陵兰岛在其管辖之内,鲸资源非常丰富。经常有鲸搁浅于格陵兰的海滩上,因此丹麦科学家有更多的机会取得这些庞然大物的标本。展馆中就陈列有蓝鲸骨骼标本,全长十几米,头骨有铲车那么大。鲸的心脏就像一口巨大的钟,挂在充满保存液的玻璃缸中展出。其实,被展出的蓝鲸骨骼在其家族中只能算是普通身材。作为地球最大的生物,其身长可以达到30余米。我们在博物馆的仓库里就看到了更大的蓝鲸骨骼,像一列小火车。
丹麦动物博物馆展示了许多特有的极地物种,如北极熊、驯鹿、麝牛,还有复原的猛犸等等。科学家们并非简单陈列,而是力图以进化论的体系与逻辑构建展览。比如在鲸的展室中,还展室了牛、羊等偶蹄类动物。达尔文在环游世界时,已经知道鲸并不是鱼而是哺乳动物,但他并不知道是哪些哺乳动物进入海洋后,演化成了鲸,也就是说鲸的进化路径并不清楚。这个问题也困扰了生物学家许多年。
直到近些年基因测序技术大规模使用后,科学家们通过对基因的研究和比对后才发现,我们最常见的牛羊等偶蹄类动物,和鲸有相近的亲缘关系。它们是鲸的近亲。后来在孟加拉发掘出一种古生物化石,通过对化石DNA的提取和测序,它被认为是鲸的进入大海的祖先。这个我们从没见过的远古生物也被丹麦科学家们复原出来,做成了模型:它就像一只狼,但没有了耳朵,有着锋利的牙齿,身体更具流线型,手脚都长出了蹼,而尾巴则像蜥蜴。
华大基因为丹麦动物博物馆的科学家们提供了技术支持。合作主要在生物多样性方面,包括鸽子基因组、蚂蚁基因组、社会动物行为遗传的研究等,发表了一系列的文章。至今最突出的成果,是2014年在《科学》上以专刊形式发表的鸟类基因组系统演化史项目,该项目彻底解决了现代鸟类起源和演化的历史争议,是演化生物学的一次重大飞跃。
“物种从何而来、如何演化、如何发展,是生物演化研究中最基础的问题。基因组的应用使我们得以重现历史,回答这些最根本的科学问题。”华大基因科学家张国捷说,“这是迄今为止对同一类群物种最大规模的基因组演化历程分析,也是我们利用比较基因组学揭示生物宏观演化历史的重要一步。”
Jon Fjelds?教授是张国捷在丹麦动物博物馆的合作伙伴。Jon留着长长的胡子,与达尔文有几分相似。他不仅是一名出众的生物学家,也是一名画家――为各种鸟类画插图。这些精美插图被应用于《科学》杂志上。在他庞大的标本仓库中,最重要的收藏是一只渡渡鸟的头骨和完整的内脏标本。渡渡鸟早已灭绝,世界上只有两处博物馆保存着渡渡鸟化石。
Jon向我们解释,鸟类是白垩纪物种大灭绝事件中的幸存者,其后它们在短期内经历了一次超级物种大爆发。然而,现代鸟类的演化历史和亲缘关系,这一最基本的问题却是困扰了学界数世纪的未解之谜。另外,鸟类快速演化形成了超过1万个不同物种,产生这些鸟类生物多样性背后的分子机制也知之甚少。
为了回答这些问题,华大基因与众多科学家组成的国际鸟类基因组联盟,共同完成了48只鸟类物种的基因组测序、组装和全基因组比较分析。这48只鸟包括乌鸦、鸭、隼、鹦鹉、企鹅、朱?q、啄木鸟、鹰等,囊括了现代鸟类的主要分支。 哥本哈根自然历史博物馆展出了很多极地动物,以进化论为主线构建了展览的陈列
之前所有试图重建鸟类演化树的努力,无论是用部分DNA测序,还是使用解剖学、行为学的特征都遇到很多的困难,所得到的演化树之间充满矛盾。研究人员表示,现代鸟类在早期发生了快速的物种形成大爆发,因为这一快速扩张的时间很短,没有演化出足够多的序列差异,因此很难区分早期分支的亲缘关系。为了估计鸟类之间的关系图谱和分化时间,研究人员决定采用全基因组的信息来构建鸟类的物种演化树。
作为研究重要成果,这棵新的鸟类演化树彻底解决了鸟类的早期分支问题,还对一些旷日持久的相关争议给出了确切的答案。比如,新发现
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