生物信息学在基因组学中的应用.PDF

安徽农业科学袁允燥怎则灶葬造 燥枣 粤灶澡怎蚤 粤早则蚤援 杂糟蚤援 圆园园7袁35渊20冤院6054-6055 袁6057 责任编辑 王 淼 责任校对 王淼 生物信息学在 因组学中的应用 沈春修 宜春学院 江西宜春 袁 336000冤 摘要 随着计算机科学 物理学 数学等与生命科学的相互渗透和交叉 生物信息学愈来愈显示出其重要性 尤其是在抗病 因的研 尧 尧 袁 袁 究中 笔者从结构 因组 比较 因组 功能 因组与生物信息学等方面论述了生物信息学在 因组学中的应用 遥 尧 尧 遥 关键词 抗性 因 结构 因组 比较 因组 功能 因组 生物信息学 曰 曰 曰 曰 中图分类号 Q78 文献标识码 A 文章编号 0517-6611 2007冤20-06054-02 因的研究是指在许多 因同时存在的 础上对多个 高度重复区域 这种区域统称为 因簇 因簇包含 袁 遥 Rpp5 因同时进行研究 分析各自与它们之间的结构与功能的相 个同源序列 散布在 的区域上 并且被蛋白激酶 袁 8~10 袁 90 kb 袁 互关系 因而它至少涉及 个相关领域 结构 因组 主 的假 因与反向转座子等隔开 因簇由 个抗性 遥 3 院 要要要 遥 Cf蛳4/9 5 要关心 碱 序列水平上的 因结构 比较 因组 因同源序列组成 散布在 的区域内 的同源序 DNA 曰 要要要 袁 36 kb 袁Cf蛳4/9 寻找种内 种属间产生 因结构差异的分子 础 以期获取 列被 因隔开 成为高度重复区域 因簇包含 尧 袁 Lox 袁 遥 Pto 5 与目的性状相关的 因 功能 因组 着重研究 因与其 个同源序列 分布在 的区域内 这其中的 因编 曰 要要要 袁 60 kb 袁 Prf 表达产物及功能活性的调控关系 结构 因组是其他领域 码NBS蛳LRR 袁对Pto 因的功能是必需的遥Dm3 因是目前 遥 的 础 比较 因组为功能 因组研究提供等位 因 蛋白 已知的最大的抗性 因 至少由 个抗性 因同源序列组 袁 袁 袁 24 质组则是在蛋白质水平上