The Hammerhead Ribozyme.pptVIP

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2017-03-25 发布于上海
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The Hammerhead Ribozyme.ppt

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The Hammerhead Ribozyme

* * The Hammerhead Ribozyme Peter J. Mikulecky What is a Ribozyme? 1) Enzyme 2) Ribonucleic Acid NOT PROTEIN 1989 Nobel Prize In Chemistry Sid Altman Tom Cech Structure As with proteins, we consider... Primary: GGCCGAACUGGUA Secondary: Tertiary: Primary Structure Limited to ribonucleotides (base + ribose + phosphate): Common Bases: Uncommon Bases: A G C U Pseudouridine Inosine etc... Secondary Structure Watson-Crick Base Pairing Helix Formation B-DNA RNA RNA usually assumes A-form helices… Small pore along helical axis “Rungs” stack obliquely to axis A-DNA Secondary Structure Conserved base-pairing interactions result in... Three “stem” regions Uridine-containing turn An “augmenting helix” joining stems II and III Ribozyme vs. tRNAPhe folding Tertiary Structure Catalytic Mechanism Intact Phosphodiester Mg2+Coordinated Transition Cleaved Phosphodiester Catalytic Mechanism New crystal structure shows five Mg2+ sites: Ribozymes in Our Past ? The Future of Ribozymes In Vitro Molecular Evolution of RNA High Throughput Screening Ribozyme-Based Therapies + In Clinical Trial... ANGIOZYME TM HEPTAZYME TM Ribozyme designed to inhibit Vascular Endothelial Growth Factor (VEGF)... ANGIOGENESIS Ribozyme targets highly conserved sequences of the Hepatitis C Virus... HCV DRUG RESISTANCE * * *