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生物信息学在蛋白质组学中的应用 摘要：生物信息学是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、化学等学科相互渗透而高度交叉形成的一门新兴前沿学科。而蛋白质组学是后基因时代标志性的研究新领域, 其快速发展很大程度上依赖于生物信息学的蓬勃壮大。从生物信息学与蛋白质数据库、蛋白质分析、蛋白质功能的联系3个方面, 对生物信息学在蛋白质组学上应用的研究进展进行综述。 关键词：生物信息学; 蛋白质组学; 蛋白质数据库; 蛋白质分析; 蛋白质功能 随着人类基因组测序计划的完成, 生命科学的重心开始转移到对基因的表达产物—蛋白质的研究上来, 蛋白质组学遂成为后基因时代的研究前沿和热点领域。因为蛋白质是基因功能活动的最终执行者, 是生命现象复杂性和多变性的直接体现者, 因此人类要揭示整个生命活动的规律, 就必须研究基因的产物—蛋白质, 从基因水平向蛋白质水平的深化成为了生物学研究发展的必然趋势。蛋白质具有自身特有的活动规律, 随着生命活动的进程表现出极其动态的紧密协调的变化。蛋白质在合成之后具有相对独立的修饰、转运和相互间作用能力, 同时还具有对外界因素发生反应的能力。因此, 蛋白质组是一个在空间和时间上动态变化着的整体, 只有从蛋白质组学的角度对所有蛋白质的总和进行研究, 即开展蛋白质组学研究, 才能更加贴近对生命现象和本质的掌握, 生命活动的本质和活动规律才能找到答案[ 1]。 1