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第四章 基因工程
基因工程(gene engineering):又称为重组DNA技术,是指将外源基因通过体外重组后导入受体细胞,并使其能在受体细胞内复制和表达的技术。
分子克隆(molecular cloning):是指在体外将制备的DNA片段与载体重组,然后导入受体细胞,并在受体细胞中复制、扩增,以获得该DNA分子的大量拷贝的技术。
第一节 工具酶(限制性核酸酶内切酶;DNA聚合酶;DNA连接酶;碱性磷酸酶;核酸酶S1)
一、限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE)
限制性核酸内切酶(RE)是一类能识别和切割双链DNA特定核苷酸序列的核酸水解酶。
限制酶主要来自于细菌,其切割序列明确,目前商品化的限制酶现有100多种。
命名:Hin dⅢ Haemophilus influenzae d株
流感嗜血杆菌d株的第三种酶
第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;
第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。
三种限制性核酸内切酶的作用:
作用 I II III 酶活性 核酸内切酶、甲基化酶、ATP酶、DNA解旋酶 核酸内切酶 核酸内切酶、甲基化酶 DN链上的特异识别位点 无 有 有 DN链上的特异切割位点 无 在识别序列内 在识别序列外 在分子克隆中的重要意义 无 有 无
Ⅱ类酶识别序列特点---回文结构(palindrome)
---------GGATCC---------
---------CCTAGG---------
切口 :平端切口、粘端切口
限制性核酸内切酶的主要用途:
①在分子克隆过程中切割DNA以获取目的基因片段、切割载体形成切口,使目的基因能插入载体。
②分析限制性片段长度多态性(RFLP),用于遗传病的诊断,法医DNA指纹分析等。
③用于构建DNA的物理图谱、基因定位及DNA同源性分析等。
二、DNA聚合酶
DNA聚合酶Ⅰ和Klenow片段;Taq DNA聚合酶;逆转录酶;末端脱氧核糖核苷酰转移酶。
⑴DNA聚合酶Ⅰ和Klenow片段:
DNA-polⅠ是单一肽链的多功能酶,分子量为103kd,它具有3种酶活性:①5,→3,聚合酶活性;②3,→5,核酸外切酶活性;③5,→3,核酸外切酶活性。
用特异的蛋白酶可将DNA-polⅠ水解成小片段和大片段,后者为Klenow片段。
Klenow片段的主要功能有:①补齐双链DNA的3,末端,同时可使3,末端DNA标记同位素;②在cDNA克隆中,合成cDNA第二链;③DNA序列分析。
⑵Taq DNA聚合酶:是一种耐热的DNA聚合酶,分子量为65 kd,最佳作用温度是70-80℃,Taq酶具有5,→3,聚合酶活性和依赖于聚合作用的5,→3,外切酶活性。
Taq DNA聚合酶可用于DNA测序及通过PCR对DNA分子的特定序列进行体外扩增。
⑶逆转录酶:是依赖RNA的DNA聚合酶,它以RNA为模板、4种dNTP为底物,催化合成DNA,此过程称为逆转录作用。
逆转录酶的功能:①逆转录作用;②核酸酶H的水解作用;③依赖DNA的DNA聚合酶作用。
⑷末端脱氧核糖核苷酰转移酶:
末端脱氧核糖核苷酰转移酶简称末端转移酶,分子量为60kd,在二价阳离子存在下,催化脱氧核糖核苷酸转移到单链或双链DNA分子的3,末端-OH上。底物是单链DNA或有3,突出末端的双链DNA,需要Mg2+参与;底物是平端或3,凹端的双链DNA,需要Co2+。
末端转移酶的功能主要有:
①在载体或目的基因3,末端加上互补的同质多聚尾,形成人工粘性末端,便于DNA重组连接。
②用于DNA 3,末端的同位素探针标记。
三、DNA连接酶
DNA连接酶包括大肠杆菌DNA连接酶和T4 DNA连接酶两种类型,分子量分别为7500和6000,两者的辅基不同,前者需NAD+,后者需ATP。它们催化的反应也不尽相同,大肠杆菌DNA连接酶只能连接粘性末端,而T4 DNA连接酶既能连接粘性末端,又能连接平末端。
四、碱性磷酸酶
碱性磷酸酶的作用是催化去除DNA、RNA或dNTP上的5,-磷酸基团,其主要用途有:
①除去DNA片段上的5,磷酸,以防自身连接。
②在使用T4多核苷酸激酶和32P同位素标记前,除去RNA或DNA上5,端的磷酸。
五、核酸酶S1
核酸酶S1可水解双链DNA、RNA或DNA-RNA杂交分子中的单链部分,其主要作用是
除去粘性末端以产生平末端、除去cDNA合成时形成的发夹结构以及分析RNA的茎环结构和DNA-RNA分子的杂交情况。
功能:水解双链DNA、RNA或DNA-RNA杂交体中的单链部分。
核酸酶S1
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