药物的设计学[第5章节 药物发现的虚拟筛选方法].pptVIP

* 第五章 药物发现的虚拟筛选方法 化学信息学 生物信息学 虚拟筛选 先导物 化学生物学 候选药物 靶点大分子 第一节 概述 虚拟筛选：针对重要疾病特定靶标生物大分子的三维结构或定量构效关系(QSAR)模型，从现有小分子数据库中，搜寻与靶标生物大分子结合或符合QSAR 模型的化合物，进行实验筛选研究。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 虚拟筛选流程 基于分子对接虚拟筛选流程 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. SARS爆发，从现有药物中快速筛选，老药，安全，直接进临床。 SARS冠状病毒(SARS-CoV)蛋白水解酶(Mpro)的同源蛋白模拟结构； 虚拟筛选现有药物库MDL/CMC(/products/knowledge/medicinal_chem/index.jsp)； 老药肉桂硫胺（抗精神分裂和抗炎）：SARS-CoV Mpro 的抑制剂； Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. (A) 肉桂硫胺的化学结构；(B) 肉桂硫胺与SARS-CoV Mpro活性位点的作用方式 （绿线：-NH?或-CH?氢键相互作用；红线：-CH?O 氢键相互作用；蓝线：C145 的巯基(-SH)与肉桂硫胺的C=C 双键作用 酶水平抑制活性IC50 为5.0μM，能抑制病毒颗粒的复制； 细胞水平抑制SARS-CoV 的活性为31μM；是冠状病毒Mpro 的专一性抑制剂。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 第二节 化学信息处理 一、化学信息的表示方法 1、一维结构表示 SMILES编码的立体化学信息表示 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 第二节 化学信息处理 一、化学信息的表示方法 2、二维结构表示 用图表示苯丙氨酸的结构 （1）图论基础和图的矩阵表示 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 第二节 化学信息处理 一、化学信息的表示方法 2、二维结构表示 乙醛的邻接矩阵表示和矩阵简化步骤 （2）化合物结构的矩阵表示 两个原子间有键相连，矩阵元素为1 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 第二节 化学信息处理 一、化学信息的表示方法 3、三维结构表示 甲烷立体结构的笛卡儿坐标系统 原子坐标随坐标原点、分子的摆放位置而变 1，2-二氯乙烷的内坐标系统 描述分子中原子和键的相对位置 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 第二节 化学信息处理 一、化学信息的表示方法 常见的分子存储格式 （1）Mol格式文件 （2）SDF格式文件 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile . Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 第二节 化学信息处理 二、化合物数据库的生成 ISIS信息管理系统 化学信息管理系统（ISIS/Host） 化学信息生成和管理软件（ISIS/Base） 化学绘图软件（ISIS/Draw） Evaluation only. Created with Aspose.Slides