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SigmaPlot应用 —— 计算多靶单击模型拟合计量存活曲线
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目前应用较多的是fertil等建立的克隆形成率分析法,是用多个剂量的多个克隆存活分数进行数学模型拟合。可通过简单的多靶单击模型S=1-(1-exp(-D/Do))^N拟合剂量存活曲线,主要获得N,No,Dq和SF2等多个放射生物学参数。
利用SigmaPlot对数据进行处理,得到拟合剂量存活曲线等。
以上分别为0,1,2,4,6GY照射后MDA-MB-231和MCF-7的SF
剂量
MDA-MB-231的SF
标差
MCF-7的SF
标差
0
1
0
1
0
1
0.8374
0.1413
0.6902
0.0641
2
0.4036
0.0413
0.2853
0.0178
4
0.1951
0.0207
0.1424
0.0315
6
0.0250
0.004361
0.0203
0.002186
克隆接种率PE=(对照组克隆数/接种细胞数)×100%存活分数SF=克隆数/(接种细胞数×PE)要绘制对数图和算出简单的多靶单击模型S=1-(1-exp(-D/Do))^N拟合剂量存活曲线,主要获得N,Do,Dq和SF2等多个放射学参数。S为剂量D对应的数值。
主要意义如下:目前应用较多的是fertil等建立的克隆形成率分析法,是用多个剂量的多个克隆存活分数进行数学模型拟合。可通过简单的多靶单击模型S=1-(1-e-D/Do)N拟合剂量存活曲线,主要获得N,Do,Dq和SF2等多个放射生物学参数。这些衡量放射敏感性的参数能较真实全面的反应细胞放射生物学特性,已被广泛应用于细胞放射敏感性分析。该种拟合获得的N,Dq,Do和SF2值,可从不同角度反应细胞放射敏感性:N值是曲线指数部分外延至Y轴的截值,称外推值,反映细胞对放射引起损伤的修复能力,N增大表示细胞修复能力增强,杀死细胞所需剂量增大,放射抗拒性增强;Dq为细胞受损所需准阈量,Dq增大,细胞存活曲线肩区增宽,放射抗拒性增强;Do为曲线指数区下降63%所需剂量,Do越大,放射抗拒性增强;2Gy时存活分数SF2是代表细胞放射敏感性的重要指标,SF2越大,放射抗拒性越强。式中S为受到剂量照射的存活分数;存活曲线的直线部分斜率的倒数为Do值,称为细胞的平均致死剂量,为使存活率下降63%所需剂量。若将直线部分外推与纵坐标相交点的数值称为外推值n,代表细胞内靶的个数或所需击中靶的次数。由纵坐标1.0处做一条与横坐标的平行线,与外推线的交点在横坐标上投影点的数值即为Dq,称准域剂量,代笔细胞累积亚致死性损伤的能力,为克服肩区的剂量。
在new worksheet 中输入数据
选择Graph中的
Create Graph
Scatter plot
Multiple Error Bars
X Many Y
按图选择数据
完成
双击y轴后在Settings中选Scaling,在Scale中选择Log(common),
在End中填写1.
选择Graph Page1,单击一组数据点,选择Statistics中的Regression Wizard,
在Equation Category中选择User-Defined并单击New选项
如图,重新编写程序
点击Finish之后显示拟合曲线,本图包含两条拟合曲线
点击Report1可查看b,c值
点击Report2,查看b,c值
如图,点击Data1可查看SF2的预计值
通过SigmaPlot可以得到结果为:b=0.7094 N=c=2.3062Do=1/b=1.4096Dq=In(c/b)=1.1789SF2=0.4722S=1-(1-exp(-D/Do))^N=1-(1-exp(-0.7094*D))^2.3062 b=0.7815 N=c=1.7722 Do=1/b=1.2796Dq=In(c/b)=0.8188 SF2=0.3408S=1-(1-exp(-D/Do))^N=1-(1-exp(-0.7815*D))^1.7722
根据上述结果,我们很好的解决了多靶单击模型拟合公式的求解,得出了N,Do,Dq,SF2等多个放射生物学参数以及所需的图片
作者: 吉林大学公共卫生学院
2009级放射医学
潘峰 王茜
指导老师:赵刚
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