生物信息复习.doc

】】】Chapter 1 PPT1 1. 什么是生物信息学？（狭义和广义） 生物信息学广义的概念是指应用信息科学的方法和技术，研究生物体系和生物过程中信息的存贮、信息的内涵和信息的传递，研究和分析生物体细胞、组织、器官的生理、病理、药理过程中的各种生物信息，或者也可以说成是生命科学中的信息科学。生物信息学狭义的概念是指应用信息科学的理论、方法和技术，管理、分析和利用生物分子数据。 2. 生物信息学的发展历史。 n 20世纪50年代，生物信息学开始孕育。 n 20世纪60年代，生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科学联系起来。 n 20世纪70年代，生物信息学的真正开端。 n 20世纪70年代到80年代初期 ，出现了一系列著名的序列比较方法和生物信息分析方法。 n 20世纪80年代以后，出现一批生物信息服务机构和生物信息数据库。 n 20世纪90年代后 ，HGP促进生物信息学的迅速发展。 3.人类基因组计划和基因组信息学的相互作用。 人类基因组计划简介：人类基因组计划准备用15年时间，投入30亿美元，完成人类全部24条染色体的3×109脱氧核苷酸对(bp)的序列测定，主要任务包括作图(遗传图谱、物理图谱的建立及转录图谱的绘制)、测序和基因识别。其中还包括模式生物(如大肠杆菌、酵母、线虫、小鼠等)基因组的作图和测序，以及信息系统的建立。作图和测序是基本的任务，在此基础上解读和破译生物体生老病死以及和疾病相关的遗传信息。 基因组：一个物种中所有基因的整体组成。 人类基因组构成——24条染色体和线粒体。 建立四张图谱：遗传图谱；物理图谱；序列图谱；转录图谱。 相互作用： 4.用狭义的方式来诠释核酸序列和蛋白质结构序列。 5. 生物信息学的目标和任务 收集和管理生物分子数据；数据分析和挖掘；开发分析工具和实用软件：生物分子序列比较工具、基因识别工具、生物分子结构预测工具、基因表达数据分析工具。 6.生物信息学主要研究内容。 （1）生物分子数据的收集与管理；（2）数据库搜索及序列比较 ；（3）基因组序列分析； （4）基因表达数据的分析与处理 ；（5）蛋白质结构预测。 7.生物信息学所用的方法和技术。 （1）数学统计方法；（2）动态规划方法 ；（3）机器学习与模式识别技术 ；（4）数据库技术及数据挖掘 ；（5）人工神经网络技术；（6）专家系统 ；（7）分子模型化技术；（8）量子力学和分子力学计算 ；（9）生物分子的计算机模拟；（10）因特网（Internet）技术。 Chapter 2 PPT 2 1. 生物大分子构成的三条基本原则： （1）构成生物体各类有机大分子的单体在不同的生物中都相同； （2）生物体内一切有机大分子的构成都遵循共同的规则； （3）某一特定生物体所拥有的核酸及蛋白质分子决定了它的属性。 2. 真核细胞和原核细胞的区别： 比较项目 原核生物 真核生物 实例 细菌、蓝藻、放线菌、衣原体、支原体（支原体细胞最小，且无细胞壁） 酵母菌等真菌、衣藻、 高等植物、动物 细胞大小 较小（1～10微米） 较大（10～100微米） 细胞结构 细胞壁不含纤维素，主要成分是肽聚糖；细胞器只有一种，即核糖体；细胞核没有核膜（这是最主要的特点）、没有核仁、没有染色质（体），但有核物质，叫拟核 细胞壁的主要成分是纤维素和果胶；有核糖体、线粒体、内质网、高尔基体等多种细胞器；细胞核有核膜、核仁、有染色质（体） 主要细胞 增殖方式 二分裂 有丝分裂、无丝分裂、减数分裂 代谢类型 同化作用多为异养型、少数为自养型（包括光合作用和化能合成作用自养型），异化作用多为厌氧型、少数为需氧型。光合作用的部位不是叶绿体而是在光合片层上；有氧呼吸的主要部位不在线粒体而是在细胞膜 同化作用有的是异养型、有的为自养型，异化作用有的为厌氧型、有的为需氧型。光合作用的部位是叶绿体；有氧呼吸的主要部位是线粒体 生殖方式 无性生殖（多为分裂生殖） 有性生殖、无性生殖 遗传方面 遗传物质 DNA DNA DNA分布 拟核（控制主要性状）；质粒（控制抗药性、固氮、抗生素生成等性状） 细胞核（控制细胞核遗传），线粒体和叶绿体（控制细胞质遗传） 基因结构 编码区是连续的，无内含子和外显子 编码区是不连续的、间隔的，有内含子和外显子 基因表达 转录产生的信使RNA不需要加工；转录和翻译通常在同一时间同一地点进行（在转录未完成之前翻译便开始进行） 转录产生的信使RNA需要加工（将内含子转录出的部分切掉，将外显子转录出的部分拼接起来）；转录和翻译不在同一时间同一地点进行（转录在翻译之前，转录在细胞核内、翻译在细