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第36章 RNA生物合成和加工
Chapter 36 RNA Biosynthesis
and Processing
遗传信息传递的中心法则
蛋白质
翻译
转录
逆转录
复制
复制
DNA
RNA
内 容
第一节 DNA指导下RNA的合成
第二节 RNA转录后的加工
第三节 RNA指导下的RNA和DNA的合成
第一节 DNA指导下RNA的合成
? 转录(transcription):生物体以DNA为模板合
成RNA的过程,转录是通过DNA的指导下的RNA聚合酶
的催化实现的。经转录生成的RNA有多种,主要的是
rRNA,tRNA,mRNA,snRNA 和 scRNA。
? 转录从DNA模板的特定位点开始,并在一定的位点
终止,此转录区域为一个转录单位。
? 转录的起始是由DNA的启动子(promoter)控制
的,控制中止的部位称中止子(terminator)。
1. DNA指导的RNA聚合酶
反应式:
n1ATP RNA polymerase
n2GTP
n3CTP DNA, Mg2+(or Mn2 +)
n4TTP
RNA +(n1+n2+n3+n4)PPi
从聚合反应的化学本质、极性和模板的使用这三方面来说,转录
与复制是相同的。但是,也存在三个主要不同点:
?转录中不需要RNA引物、以4种三磷酸核糖核苷(NTP)为底物;
?转录反应一般只用一小段DNA做模板;
?在转录区,一般都只有一条DNA链可以作为模板。
启动子 终止子
模板链(负链,反意义链)
编码链(正链,有意义链)非信息区
DNA
5′
5′3′
3′
两股DNA单链中只有一股可转录,可作为模板转录成
RNA的一股称为模板链,对应的一股互补链称为编码
链。能转录出mRNA然后指导蛋白质合成的部分称为结
构基因。其余的DNA可能转录(rRNA,tRNA),也可能不
转录。
不对称转录:DNA分子上一股可转录,另一股不转录;模
板链并非永远在同一单链上。
大肠杆菌RNA聚合酶(456 kD)
?
?
??
??
核心酶(α2ββ?)
起始因子
α—— 酶的装配与启动子上游元件和活化因子结合
β
β?
?—— 识别启动子,促进转录的起始
??????
全酶(α2ββ? ?)
?
2 Zn
结合核苷酸底物
催化磷酸二酯键形成
和模板DNA结合
催化中心
转录泡,17bp
杂交体,8bp
酶的移动方向
大肠杆菌RNA聚合酶进行的转录
RNA合成过程
起始
(pppG or pppA)
双链DNA
局部解开
磷酸二酯
键形成
终止阶段
解链区到达
基因终点
延长阶段
5? 3?
?
RNA
启动子
(promoter)
终止子
(terminator)
5?
?
RNA聚合酶
?
5??
3?
5?
?
3?
5?
5? 3?
NusA
离开
识别
NusA
3-9 nt
大肠杆菌RNA聚合酶与DNA的相互作用
β:与DNA疏水作用
β?:与DNA静电作用
真核生物的RNA聚合酶
?三种RNA聚合酶Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,它们专一地转录不同的
基因,其转录过程和产物各不相同。
?三种RNA聚合酶对鹅膏覃碱的敏感性反应不同。
snRNA (U6), scRNA
r5s-rRNA
(5.8,18,28S rRNA)
2. 启动子和转录因子
启动子( promoter)是指RNA聚合酶识别、结合和
开始转录的一段DNA序列。 RNA聚合酶起始转录需要的
辅助因子(蛋白质)称为转录因子(transcriptional
factor)。
利用足迹法(footprint)和DNA测序法可以确定启
动子的序列结构。
足迹法确定
启动子序列
— +
Footprinting results of RNA
polymerase binding to the Lac
promoter. In this experiment
the 5 end of the
Non-template strand was
Radioactively labeled. Lane C
is a control in which the
labeled DNA fragment were
cleaved with a chemical
reagent that produces more
uniform banding pattern
大肠杆菌启动子共有序列
××
A
G
T
C
TTGACA×××× ××××××××××××××TAT
××××××××××××××ATA
AAT××××××
AACTGT×××
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