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20162基因表达与调控汇编
第一节 概述
第二节 转录水平的调控
第三节 操纵子类型
第2章 原核生物基因表达调控
第一节 概述
(Introduction)
1、 原核生物对环境的适应,相关的应答
是基因表达的结果
2、 基因表达的调控涉及
RNA转录的开/关,数量,选择性加工
蛋白质翻译速率,数量,加工与 降解和分泌…
调控机理上
调控层次上
3、转录水平上的调控是最为经济,
灵活,又是最为重要,复杂的调控
在复杂的基因组内,确定需要基因转录的起始位点
精细调节基因表达的水平, 以保证生物体对环境的适应
保证RNA polymerase 的进行式转录(不中断,准确终止)
4、 生物遗传信息的概念
Genome DNA
遗传信息的两大类别
II类;特定DNA seq. + 特定蛋白质/ 核酸结合
5、 遗传信息表达的方式
组成型表达(constitutive expression)
Housekeeping gene
诱导型表达
(inducible expression by signaling molecular)
Luxury gene
操纵子:启动子、操纵基因、结构基因和终止子
结构基因:编码蛋白质或RNA的任何基因
调节基因:参与其他基因表达调控的RNA 和蛋白质的编码基因
阻遏物和激活物(调节基因编码的调节蛋白)
HTH结构
正调控:调节蛋白与DNA特定位点的相互作用,启动或增强操纵子的转录活性
负调控
诱导物:能够结合在阻遏物或激活物上启动操纵子的转录的效应物
共阻遏物:能够结合在阻遏物上关闭操纵子的转录活性的效应物
6、几个基本概念
诱导物引起正调控
共阻遏物引起负调控
第二节 转录水平的调控
转录是遗传信息由DNA转换到RNA的过程。作为蛋白质生物合成的第一步,转录是mRNA以及非编码RNA(tRNA、rRNA等)的合成步骤。
1、细菌的RNA 聚合酶:5个亚基组成,分子量为480kD,α2ββ‘σ ?, α2ββ‘?组成核心酶, σ亚基主要功能是参与启动子的识别和结合以及转录起始复合物的异构化,体积大,横跨60个碱基。
2、启动子
TTGACA
TATAAT
A/G
16-19bp
5-9bp
核心酶
σ因子
-35区(识别部位) -10区(结合部位) 转录起始位点
3、上游激活序列和操纵基因
UAS Operator
与启动子重叠
激活蛋白
RNApol
阻遏物
4、转录过程
σ识别-35区
核心酶结合在-10区
DNA双链打开
1个三磷酸核苷酸(A或G)与模板链结合构成RNA的5’端
以磷酸二酯键的形式与第二个核苷酸结合,形成6-9个核苷酸, σ因子释放
形成转录泡
RNA-DNA杂合链
在多种生物体细胞中发现了不同的σ因子,根据其分子量来命名,例如 E.coli 中有σ70 和σ32,正常情况下σ70 负责多种基因的转录;σ32少量存在,热激条件下, σ32含量增加,促进热激蛋白基因的转录。
分子伴侣:正常细胞中指导新合成的蛋白质的折叠;热激后与变性蛋白结合,指导它们重新折叠而使它们恢复生物活性。
5、 σ因子与转录起始调控
6、终止子:强终止子和弱终止子
转录终止点之前有7-20bp反向重复序列,产生的mRNA可以形成茎环状的发夹结构。
转录终止位点的序列结构:
GTCAAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGACTCAGTTTTCGGAGGCCAGCCTCCGAAAACTGA
其反向重复序列富含GC,下游常有6-8个A,转录后含有相对应的U,是使RNA聚合酶脱离模板的信号。
1)不依赖ρ因子的终止子(强终止子)
不依赖于ρ因子的终止子转录终止模型
被转录的RNA可以在终止子处形成茎环状的RNA-RNA发荚结构,其稳定性比RNA-DNA杂合链稳定性高,可以把RNA聚合酶和RNA都从DNA链上脱离下来,从而终止转录。
2)依赖于ρ因子的终止子(弱终止子) ρ因子有RNA结合位点和ATP结合位点,以六聚体形式起作用,可以辅助转录终止
ρ因子只引起没有正在进行翻译的RNA合成终止
ρ因子是RNA-dependent ATPase,需要RNA存在
ρ因子能使RNA-DNA杂合双链解旋
ρ因子结合在RNA的不被核糖体翻译的rut位点,利用水解ATP的能量沿着RNA链按5’-3’方向移动;
当RNA聚合酶遇到终止子暂停转录时, ρ因子可以在终止子处追赶上RNA聚合酶,并跻身于转录泡的RNA-DNA杂合链中;
ρ因子的RNA-DNA解旋酶活性使RNA-DNA杂合链解旋,使RNA
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