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- 2017-04-24 发布于湖北
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SSR数据处理宏程序DataTrans1.0
分子植物育种(网络版), 2011 年, 第 9 卷, 第 1359-1365 页
Fenzi Zhiwu Yuzhong (Online), 2011, Vol.9, 1359-1365
http://mpb. ?
技术主题
Technology Feature
SSR 数据处理宏程序 DataTrans 1.0
盖红梅 1 , 任民 2
1.青岛市农业科学研究院/农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室, 青岛, 266100
2.中国农业科学院烟草研究所/中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室, 青岛, 266101
通讯作者: renm79@126.com; 作者
分子植物育种, 2011 年, 第 9 卷, 第 48 篇 doi: 10.5376/.2011.09.0048
收稿日期:2011 年 03 月 10 日
接受日期:2011 年 04 月 13 日
发表日期:2011 年 04 月 21 日
这是一篇采用 Creative Commons Attribution License 进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条
件的使用与传播。
引用格式:
盖红梅等, 2011, SSR 数据处理宏程序 DataTrans 1.0, 分子植物育种 Vol.9 No.48 (doi: 10.5376/.2011.09.0048)
摘 要 随着群体遗传学研究的不断深入和高通量基因分型技术的成功实施,越来越多的研究需要处理大量的 SSR 数据。而
原始数据格式往往与不同分析软件的输入格式之间存在较大差别,由此,SSR 数据前期处理日益成为数据分析过程中的限速
步骤。为此,本研究应用 Excel 的 VBA 语言开发了一套进行 SSR 数据处理的宏程序 DataTrans1.0。该程序可以实现由原始
的 bp 数据,转换为 Ntsys 软件需要的 0, 1 格式、Popgene 软件需要的基因型格式及 PowerMarker、Structure 和 Tassel 等软件
的输入格式;还可以实现由 0, 1 数据转换为 Popgene 软件需要的基因型格式。与人工转换相比,DataTrans 1.0 大大提高了数
据转换的效率和准确性,是广大群体遗传学和基因组学研究人员不可或缺的重要桥梁工具。
关键词 数据处理; 数据转换; Excel 宏
DataTrans1.0, A Software for Microsatellite Data Processing Based on Excel
Macro
Ge Hongmei 1 , Ren Min 2
1. Qingdao Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Huanghuaihai Crop Genetic Improvement and Biotechnology, Ministry of Agriculture,
Qingdao, 266100, P.R. China
2. Tobacco Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Tobacco Genetic Improvement and Biotechnology, Chinese
Academy of Agricultural Sciences, Qingdao 266101, P.R. China
Corresponding author
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