生物信息学常用软件简介-引物设计幻灯片.pptVIP

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2017-04-21 发布于河南
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生物信息学常用软件简介-引物设计幻灯片.ppt

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生物信息学常用软件简介 ;提纲 ;PCR (Polymerase Chain Reaction) ;1983.4 Kary Mullis在开车前去北加利福尼亚红树县Redwood country的一条被月光笼罩的山路上构思了PCR 随后卖给了Roche公司价格：10.000$ 1993 Nobel prize ;PCR反应体系的五要素：引物、酶、dNTP、模板和Mg2+ Taq DNA聚合酶 - 来自水生栖热菌(Thermus aquaticus) 良好的耐热性 Mg2+依赖性无校读功能; PCR反应体系的准备 ;;PCR的基本原理; 何为PCR 引物？;引物(primers);引物的重要性; PCR 引物设计一般原则;引物设计要求;引物长度 ;碱基分布的均衡性;引物Tm值;引物二级结构;引物3’端;引物5’端; 引物的内部稳定性;引物的保守性与特异性;扩增区域的二级结构;引物与PCR; PCR 引物设计主要工具;;;;Primer Premier 5.0 简介;Primer Premier 5.0 简介;Primer Premier 5.0 的使用;Primer Premier 5.0 的使用;Primer Premier 5.0 的使用;Primer Premier 5.0 的使用;Primer Premier 5.0 的使用;Oligo 6.22 使用简介 ;Oligo 6.22 使用简介 ;Oligo 6.22 使用简介 ;Oligo 6.22 使用简介 ;Oligo 6.22 使用简介 ;Oligo 6.22 使用简介 ;点击任一行出现“PCR”窗口，告知你扩增片断的位置，最合适的退火温度等等信息。 ;关掉“PCR窗口”和“primer Pairs窗口”回到原来的窗口你就能看到你引物的序列和位置，图中手型鼠标所指即为引物序列 ;至此引物设计已经完成，你可以用“Analyse”菜单分析你的引物：有无引物二聚体、发卡结构等等 ;;Blast 分析序列同源性;;;FASTA格式又称Pearson的格式，该种序列格式要求序列的标题行以大于号“”开头，下一行起为具体的序列。一般建议每行的字符数不超过60个，以方便程序处理。举例：;;电泳中的注意细节;PCR 常见问题探讨;琼脂糖凝胶浓度与DNA分子的有效分离范围;maker;;作业