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北京化工大学环境生物学-范成成
1.PCR即聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction) 是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。2.环境生物技术也叫环境生物工程,是近年来一门由现代生物技术与环境工程相结合发展起来的新兴交叉学科。目前还没有统一的定义。简言之,就是自然界中涉及环境污染控制的一切与生物技术有关的技术。3.共代谢:有一类物质称为外生物质或异生物质,是指一些天然条件下并不存在的由人工合成的化学物质,例如杀虫剂,杀菌剂和除草剂等,其中许多有易被各种细菌或真菌降解,有些则需添加一些有机物作为初级能源后才能降解,这一现象称为共代谢。4.微生物农药是指由微生物产生的用于防治农作物病、虫、草害或促进植物生长的农用抗生素类或毒素类生物制剂。主要包括农用抗生素和活体微生物. 5.半抗原:是指能与对应抗体结合表现出抗原-抗体反应,但又不能单独激发人或动物体产生抗体的抗原,其只有反应原性(与抗体发生特异性反应),不具免疫原性(刺激机体产生一系列免疫反应)。6.SIP:Stable isotope probe1.环境生物技术的层次性:高层次:是指以基因工程为主导的近现代污染防治生物技术,如构建各种高效基因工程菌以降解杀虫剂、除草剂、多环芳烃类污染物,创造抗污染型转基因植物,通过基因工程手段改造微生物生产可生物降解材料(生物塑料、生物絮凝剂、生物吸附剂)或降解固体废弃物等。中层次:指传统的废物生物处理技术(如废水处理的活性污泥法、生物膜法等),以及在新的理论和技术支撑下开发出的一系列废物强化处理工艺(如生物流化床等)。低层次:指利用天然处理系统进行废物处理的技术(如氧化塘、人工湿地、土地处理系统、农业生态工程等),其特点是发挥自然界的生物自净功能,易于操作管理,投资运行费用少。2.PLFA方法理论基础:生物标记物通常是微生物细胞的生化组成成分,其总量与微生物量呈正相关;特定结构的标记物标志着特定类型的微生物,因此一些生物标记物的组成模式(种类、数量和相对比例)可作为指纹估价微生物群落结构醌指纹法、脂肪酸图谱法等. 磷脂脂肪酸是活微生物细胞膜的重要组分。方法基础1细胞死亡后数分钟到数小时内细胞酶水解和释放磷脂,PLFA被分解2不同类群的微生物能通过不同的生化途径合成不同的PLFA.3部分PLFA总是出现在同一类群微生物中,而在其它类群的微生物中很少出3.PCR知识. 模板:作为扩增的模板。引物: 促使dNTP结合到模板链上从而扩增。耐热聚合酶: 催化形成互补链。dNTP:dNTP是PCR反应的原料,其浓度与质量和PCR反应效率有密切关系;dNTP使用浓度过高易产生错误掺入,或得不到扩增产物,过高dNTP浓度还可能导致Mg2+浓度下降;使用浓度过低,PCR产物下降。二价阳离子: Mg2+是PCR反应的稳定剂,是耐热聚合酶的重要影响因子,对PCR产物的特异性及产量有显著影响;Mg2+浓度过低,会降低Taq DNA酶的活性,产物下降;Mg2+浓度过高,会使反应特异性降低反应缓冲液:一种不易改变ph值得溶液给每一个酶反应,每一个细胞以及每一种物质的提取提供一个最佳的ph值。水:作为一种溶剂,构建反应体系4. 假阳性结果:1微生物的自身荧光。许多霉菌和酵母菌如铜绿假单胞菌属、军团菌属、蓝细菌属和古细菌如产甲烷菌等有荧光,这降低了信噪比,同时也掩盖了特异的荧光信号2微生物的培养基、固定方法和封闭剂对荧光的信号强度均有很大的影响;假阴性结果1假阴性结果主要是由于探针渗透不足导致的,常发生在革兰氏阳性菌中2荧光信号衰减(光照)3目标DNA或RNA丰度太低5. BIOLOG法:应用:微生物鉴定.微生物群落结构.检测原理:BIOLOG公司独特创的碳源利用方法,以微生物对不同碳源代谢率的差异,针对每一类微生物筛选95种不同碳源,配合四唑类显色物质(如TTC、TV),固定于96孔板上,接种菌悬液后培养一定时间,通过检测微生物细胞利用不同碳源进行新陈代谢过程中产生的氧化还原酶与显色物质反应导致的颜色变化(吸光度)以及由于微生物生长造成的浊度差异,与标准菌株数据库比较,即可得出鉴定结果。6. 提高采收率原理:1微生物的直接作用。通过微生物的生长繁殖,占据空隙空间,在油膜下生长,最后把油膜推开,使油释放出来.2改变原油组成。通过微生物的降解作用,使原油碳链断裂,重质成分减少,轻质成分增加,降低原油黏度,提高原油的流动性.3改变原油的驱油环境。利用微生物在油藏中的有益活动、微生物代谢产生的酶类与油藏中液相和固相的相互作用,改变原油/岩石/水界面性质,以及通过气体如CO2、H2、CH4等增加油层压力;4综合作用,利用微生物的直接和间接作用改变原油的流动,提高开采率7.什么是微生物冶金?指利用某些微生物或其代谢产物对某些矿物(主要为硫化矿物)和
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