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基于差异共表达识别肝细胞癌患者预后的相关基因.pdf
·642· 国际遗传学杂志 2016 年 10 月 15 日第 39 卷 第 5 期 .15,2016, .39, .5
Int J Genet Oct Vol No
· 论 著 ·
基 于 差 异 共 表 达 识 别 肝 细 胞 癌 患 者
预 后 的 相 关 基 因
孙辉 张博文 张明宇
【 摘要】 目的 探 索 肝 细 胞 癌 ( , ) 相 关 基 因 的 表 达 对 患 者 预
hepatocellular carcinoma HCC
后的影响及潜 在的作用机制 。 方法 下 载 数 据 库 3 水 平 下 的 2 数 据, 利
TCGA level RNASeq V
用 外显 子 来 计 算 基 因 的 表 达。 构 建 差 异 共 表 达 的 基 因 互 作 网 络 , 从 中 提 取 最 大 组
read count
分。 利用 搜索 子网。 结合多 变量 风险回归 模型和 - ( - ) 生 存分析来
CFinder Cox Kaplan Meier K M
识 别 患者 预后的相关 基因。 通过 通 路 映 射 来 分 析 相 关 基 因 潜 在 的 作 用 机 制 。 结
HCC KEGG
果 识别了 17 个 患 者预后相关 基因, 其 中 只 有 FGF9 同 时 参 与 模 块 15 和 模 块 22 两 个
HCC
相 关子网( P =5畅86 -06 ,P =1畅74 -06 ) 。 FGF9 恰好处于 信号通路 的起始位置,其表
E E MAPK
达 能影响下游 信号的传 递,进而 对细胞 的 增 殖 和 分 化 产 生 影 响 。 结 论 基 因 FGF9 表 达
Ras
的 失调可能会 通过影响细 胞的增殖和分 化功能来影 响肝细胞癌 患者预后。
【 关键词 】 肝细胞 癌; 预 后; 差 异共表达网 络
基金项目:哈尔滨 医科大学医 学基础青年 科学研究专项 ( 2016 55 )
JCZX
Identification of prognosis-associated genes in hepatocellular carcinoma patients
倡
Sun Hui , Zhang Bowen, Zhang Mingyu
倡
( Laboratory
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