微生物生态23219幻灯片1.pptVIP

第八章 微生物生态; 微生物生态学(microbiological ecology): 是研究微生物群体、微生物区系与其周围生物和非生物环境条件间相互作用的规律的一门分支学科。 ;第一节 自然环境中微生物的分布;一、土壤中的微生物; 2.微生物在土壤剖面的分布： （1）有机层（organic horizon) （2）好氧层(aerated horizon) （3）淋溶层(eluviated horizon) （4）水饱和层（water saturated horizon);二、水体中的微生物 1.淡水微生物 （1）根据水体中有机物含量及其与微生物关系 清水型水体微生物 ：化能自养和光能自养微生物 腐败型水体微生物 ：化能异养微生物和原生动物 水体自净作用： （2）根据水体垂直分布及其与微生物分布关系 浅水区微生物:蓝细菌、光合藻类 深水区微生物：厌氧光合细菌 湖底区微生物：厌氧菌、产甲烷菌 ;2.海洋微生物 （1）海洋微生物定义： 海洋土著微生物：只能生存在海洋或模拟海洋环境中（必须生活在含盐量2～4％的环境中）。 海洋外来微生物：由雨水、河流从陆地带入海洋，既可淡水、又可海水生存，具有耐盐能力。 （2）海洋垂直分布区及其微生物分布： 漂浮生物层(neuston):水与空气交界面，薄，仅约10 mm厚 透光区(euphotic zone):从海面到海面以下100 ～ 200 m的区域 无光区(aphotic zone):光线能够到达的区域以下 沉积物区(benthos):海床和海床表面以下的海底沉积物 ;可燃冰;3.温泉微生物 嗜热和超嗜热微生物 菌株121 ;三、空气中的微生物;四、生物体内外生存的微生物; 2.植物体微生物菌群 （1）根际微生物 （2）附生微生物的微生物。 （3）内生微生物 ;五、自然环境中未能培养微生物及其研究方法; 2.分子生物学方法 （1）直接提取DNA法 从土壤或水样中提取微生物DNA，制备DNA文库，进行测序分析。 （2）小亚基rRNA法 通过PCR直接从土壤、水或其它天然样本材料中扩增16S rRNA或18S rRNA基因，进行测序分析。但所鉴定的微生物没有分离并进行个体研究，因而被称作系统型（phylotype）。 （3）变性梯度凝胶电泳法（DGGE） 从微生物群落中提取DNA，以此为模板扩增原核16S rRNA或真核18S rRNA基因，然后在变性凝胶中电泳，当遇到适当浓度变性剂，就变性成为单链，停止在电场中的迁移。不同DNA片段所含的碱基成分不同，变性成为单链所需变性剂的浓度也就不同，这样就在琼脂糖凝胶上形成了不同的电泳条带。;六、微生物资源的保护与开发利用; 中性关系 两个微生物种群之间或微生物种群与其它生物间缺乏相互作用。 中性关系不可能在微生物群落中具有相同或相似功能的种群之间 发生，而只能在代谢类型相差极大的种群之间存在。; 互生关系 指两种可以单独生活的生物，当它们生活在一起时，通过各自的代谢活动而有利于对方，或偏利于一方的一种生活方式。 1.微生物与微生物之间的互生关系;2.动植物与微生物之间的互生关系 人体肠道细菌：大肠中生活着60～400种不同的微生物，占粪便干重三分之一的是细菌，总数约100万亿个。据研究，大肠杆菌可在肠道中合成若干种维生素供人体利用。 植物根际微生物和植物附生微生物：根际微生物在根际的大量繁殖，强烈地影响植物的生长发育。主要为：①改善了植物的营养条件；②分泌植物生长刺激物质；③分泌抗生素类物质；④根际微生物有时也会对植物产生有害的影响。 ;植物的内生菌根和外生菌根的横切面;奶牛的瘤胃微生物代谢关系示意图; 外共生微生物（ectosymbiont）：生活在共栖宿主的细胞外或组织外的微生物。如白蚁可吞食木材和纤维质材料，却不能分泌水解纤维素的消化酶。在白蚁的后肠中至少生活有100种原生动物和微生物（已鉴定的有30多种），这些类群多数具有水解纤维素的水解酶。 内共生微生物（endosymbiont）：生活在共栖宿主细胞内的微生物。如蚜虫的体细胞质中含有蚜虫巴克纳氏菌（Enterobacteriaceae buchnera），在成熟的蚜虫的身体中有数以百万的这种细菌。这种菌向宿主提供氨基酸，特别是色氨酸，如果用抗生素处理会导致蚜虫的死亡。;四、寄生关系（parasitism） ;五、拮抗关系;六、捕食关系（predatism, predation） ;一、碳素循环;二、氮素循环;三、硫素循环;四、磷素循环;五、铁素循环;第