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第二十章 生物能学;一、有关热力学的一些基本概念;开放体系:与环境进行物质交换和能量传递
封闭体系:与环境有能量传递,无物质交换
隔离体系:与环境无能量传递,无物质交换
体系的性质包括压力、体积、温度、组成、比热、表面张力等。
热力学用体系的性质描述一个体系所处的状态。;(二)能的两种形式---热与功;(三)内能和焓的概念;(四)热力学第一定律;(五)热力学第二定律和熵的概念;(六)自由能的概念;二、化学反应中自由能的变化和意义
(一)化学反应的自由能变化公式
ΔG = ΔH – TΔS
(二)标准自由能变化和化学平衡的关系
标准自由能变化是在规定的标准条件下的自由能的变化。用?G0表示。标准状态被规定在25oC,1大气压,所有溶质的浓度是1mol的反应。
一个反应的自由能变化与该反应的平衡常数相关。
;对化学反应 aA+bB → cC+dD
达到???学平衡时
?G0 =-2.303RTlgKeq
因为大多数生化反应发生在或接近pH7,这pH值已被设计为生物能学中的标准pH。在pH7的标准自由能变化用?G0 表示,以区别于?G0 。;(三)标准生成自由能及其应用
反应的ΔG0可以通过反应物和产物的标准生成自由能计算获得:ΔG0=SΔG0f 产物 – SΔG0f 反应物
(四)偶联化学反应标准自由能变化的可加性及其意义;(五)化学反应和自由能关系的进一步说明
只有ΔG0的反应才能自发进行。但要注意:
(1) ΔG0的反应可以和ΔG0的反应偶联,使反应能够实际发生。
(2) 有些ΔG00的反应,在非标准状态下,ΔG有可能0。
(3) 热力学第二定律只能确定反应的方向和限度,不能预示反应过程的速率,许多ΔG0的反应,需要提供活化能或使用催化剂才能使反应实际发生。;(六)能量学用于生物化学反应中的一些规定
(1)水作为反应物或产物时,水的浓度通常规定为1(实际浓度约为55.5mol/L)。
(2)生物体系的pH规定为7.0,称作生物体系的标准自由能变化,用ΔG0?表示。如果反应体系的pH不等于7.0,就不能使用ΔG0?。
(3)标准自由能的单位用 kj/mol 表示。; 例:当磷酸二羟丙酮 与 3-磷酸-甘 油醛互变达到平衡时,
浓度比为 0.0475(Keq)
pH=7, 25℃ 1atm
判断:当磷酸二羟丙酮为 2 x 10-4 mol/L ,3-磷酸-甘油醛 为 3 x 10-6 mol/L时,反应怎样进行?;该反应平衡点时:
[甘油醛-3-磷酸]
K= = 4.75x10-2
[磷酸二羟丙酮];△GO` = - RTlnKeq
= - 2.303 x 1.98x10-3 x298 x log (0.0475)
= 1.81kcal/mol
=7.57kJ/mol;△G = △GO`+ RTln[产物]/[反应物]
= 1.81kcal/mol +2.303 x 1.98x10-3 x298 x log [3 x 10-6 mol/L (甘) / 2 x 10-4 mol/L (丙)]
=-0.677 kcal/mol = -1.01kJ/mol;三、 高能化合物;类似的活化反应十分普遍存在。;硫酯键化合物 ~ S
甲硫键化合物 CH3~S+- C-C;1,磷氧键型(- O~P);氨甲酰磷酸;(2)焦磷酸化合物;(3)烯醇式磷酸化合物;2, 氮磷键型;3,硫酯键型;4, 甲硫键型;(三)ATP的结构特点;;1、酸酐键上的P争夺电子,导致使氧桥的稳定性降低,甚至断裂。;高能化合物由于内在因素本身化学不稳定(G高),水解产物稳定(G低)。;(四)细胞内影响ATP自由能释放的因素
ATP和ADP均由多种解离形式,并且可以同金属离子相互作用,这些引均可影响自由能的释放。;ATP水解释放自由能与pH的关系;ATP水解释放自由能与其浓度的关系(pH 7.0, 38oC);;(五)ATP 在能量转运中的地位和作用;类似的活化反应十分普遍存在。; 磷酸肌酸 暂时储能物质;磷酸肌酸(哺乳类);在机体中,由于反应物和产物的浓度接近平衡点,所以,所以,当反应物或产物的量有所变化时,机体会很灵敏地进行调节,使反应朝ATP生成或磷酸肌酸生成的方向进行。磷酸肌酸被称为ATP缓冲剂。;(七)ATP断裂形成AMP和焦磷酸的作用 ;(八) 其他三磷酸核苷的递能作用;能量源自;(九)ATP系统的动态平衡
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