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第二节 染色质
1848年,Hofmeister从鸭跖草的小孢子母细胞中发现染色质。 1879年,W. Flemming提出了染色质(chromatin)这一术语, 用以描述染色后细胞核中强烈着色的细丝状物质。 1888年,Waldeyer正式提出染色体(Chromosome)的名称。
一、染色质的化学组成
染色质由DNA、组蛋白、非组蛋白及少量RNA组成,比例为1:1:(1-1.5):0.05。DNA与组蛋白的含量比较恒定,非组蛋白的含量变化较大,RNA含量最少。;(一)DNA
DNA是遗传信息的携带者(少数病毒为RNA).
DNA-染色体-基因组
大肠杆菌(4.2×106 bp, 2350个基因)
酵母菌(1.3×107 bp, 6100个基因)
国蝇(1.4×108 bp, 8750个基因)
人(3×109 bp, 约有1米长,含3-4万个基因);DNA的序列可分为3种类型:
单一序列(主要为基因编码序列,一个或几个拷贝,比例少于5%);
中度重复序列(101-5),分为短散的重复序列(一般少于500 bp)和长散的重复序列(一般多于1000 bp),与基因选择性表达的调控有关;; 高度重复序列(105),分为卫星DNA (satellite,重复单位长5-100 bp),主要分布在着丝粒区域; 小卫星DNA(minisatellte DNA, 单位长12-100 bp,拷贝数可变,常用于DNA指纹(DNA finger-printing)技术),微卫星DNA(microsatellte DNA,单位1-5 bp,常串联达50-100 bp,具有高度多态性,遗传上保守,但个体差异较大),用于构建遗传图谱。;DNA的双螺旋结构; DNA的二级结构存在3种主要类型,即:B-DNA、Z-DNA、A-DNA。其中, B-DNA的二级结构稳定,在细胞中是主要存在形式; A-DNA是B-DNA的重要变构形式; Z-DNA是左手螺旋。
B-DNA是活性最高的构象,A-DNA 的活性次之,Z-DNA的活性最低。
在细胞中DNA的三种构型是动态变化的,以此调控染色体的动态结构变化和基因的复制、转录。;三种不同构象的DNA双螺旋;;(二)染色质蛋白质
负责DNA分子中遗传信息的组织、复制和阅读
1、组蛋白(与DNA非特异性结合)
组蛋白带正电荷,含精氨酸,赖氨酸,属碱性蛋白,其含量恒定,在真核细胞中组蛋白共有5种,分为两类:一类是高度保守的核心组蛋白(core histone)包括H2A、H2B、H3、H4四种;另一类是可变的连接组蛋白(linker histone)即H1。; 核心组蛋白的结构非常保守,特别是H3和H4,牛和豌豆H4的102个氨基酸中仅有2个不同。核心组蛋白高度保守的原因可能有两个:其一是核心组蛋白中绝大多数氨基酸都与DNA或其它组蛋白相互作用,可置换而不引起致命变异的氨基酸残基很少;其二是在所有的生物中与组蛋白相互作用的DNA磷酸二脂骨架都是一样的。; 四种核心组蛋白通过C端疏水的氨基酸相互结合,N端带正电荷的氨基酸向外伸出,与DNA分子结合,使DNA分子缠绕在组蛋白核心周围,形成核小体。尾部含有大量赖氨酸和精氨酸残基,为组蛋白翻译后进行修饰的部位,如乙酰化、甲基化、磷酸化等。
H1不仅具有种属特异性,而且还有组织特异性,所以H1是多样性的。;;2、非组蛋白
非组蛋白是染色体上与特异DNA序列结合的蛋白质,又称序列特异性DNA结合蛋白。包括多种参与核酸代谢与修饰的酶类、核质蛋白、骨架蛋白、基因表达和染色体结构调节蛋白等。
凝胶迟滞电泳和ChIP实验;(1)非组蛋白的特性
①含有较多的天门冬氨酸、谷氨酸,带负电荷,属酸性蛋白质;②整个细胞周期都进行合成;③能识别特异的DNA序列,识别信息存在于DNA本身,位点在大沟部分,识别与结合靠氢键和离子键;④具有多样性和异质性;⑤具有多种功能,如帮助DNA分子折叠,以形成不同的结构域,从而有利于DNA的复制和基因的转录,协助启动DNA复制,控制基因转录,调节基因表达。;①a螺旋-转角-a螺旋模式
蛋白质形成对称的同型二聚体,每个单位由20个氨基酸的小肽组成,两个a螺旋相互连接成β转角。羧基端的a螺旋负责识别DNA大沟的特异碱基信息,另一个螺旋与磷酸戊糖链骨架接触。;;③亮氨酸拉链式模式
蛋白的肽链羧基端约35个氨基酸残基有形成a螺旋的特点,每两圈(7个氨基酸残基)有一个亮氨酸残
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