凡纳滨对虾论文凡纳滨对虾AMYCTSL基因SNPs及其与生长性状的关联分析.docVIP

凡纳滨对虾论文：凡纳滨对虾AMY、CTSL基因SNPs及其与生长性状的关联分析 【中文摘要】本研究以海南南疆生物技术有限公司对虾繁育中心凡纳滨对虾繁育群体的379尾个体为研究对象,采用PCR-RFLP/PCR-SSCP标记技术结合DNA测序方法对研究凡纳滨对虾群体的AMY基因和CTSL基因的遗传多态性进行了分析,同时与生长性状进行相关性分析,以检测对凡纳滨对虾生长发育具有影响作用的分子遗传标记,旨在为凡纳滨对虾高效选育提供遗传学依据。1.凡纳滨对虾AMY基因多态性分析对凡纳滨对虾AMY基因的8个基因座A2-A9进行检测,分别包含了外显子2-9区域,在A2、A3、A7、A8和A9这5个基因座中未发现多态性,在A4、A5和A6基因座上发现了多态性,PCR-SSCP/PCR-RFLP检测结果分别出现了3种带型。对A4、A5和A6基因座不同带型的PCR扩增产物进行测序,共发现4个SNP位点,分别为:第4外显子109bp处T→C的突变、第4内含子46bp处T→C的突变、第5外显子123bp处C→T的突变和第6外显子81bp处C→T的突变,其中A4基因座的2处突变表现为连锁突变,4处突变均未引起氨基酸的改变,表现为沉默突变。对AMY基因多态位点遗传结构分析,结果A4、A