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PAGE   PAGE \* MERGEFORMAT 17 (I)Departamento de Genética, Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiróz, Universidade S?o Paulo (USP), Avenida Pádua Dias n.11, CP.9, 13418-900, Piracicaba, S?o Paulo, Brasil. E-mail:  HYPERLINK mailto:fersalvato@ fersalvato@. *Autor para correspondência. (II) Departamento de Ciências Biológicas, Universidade Estadual Paulista (UNESP), Avenida Dom Antonio, 2100, 19806-900, Assis, S?o Paulo, Brasil. E-mail: HYPERLINK mailto:mayra@assis.unesp.brmayra@assis.unesp.br Métodos e estratégias em prote?mica e suas aplica??es na área vegetal Methods strategies in proteomics and their applications in plants Fernanda SalvatoI* Mayra Costa da Cruz Gallo de CarvalhoII -REVIS?O BIBLIOGRáFICA- RESUMO A implementa??o da espectrometria de massa (MS) para as análises de peptídeos (MS) e de aminoácidos (MS em tandem ou MS/MS) tornou possível a identifica??o de centenas de proteínas em experimentos únicos. Uma grande variedade de estratégias está disponível atualmente para o fracionamento e a purifica??o de amostras, a identifica??o de proteínas, a quantifica??o, a análise de modifica??es pós-traducionais (MPT’s) e os estudos de intera??o. Dessa forma, a prote?mica abre novas perspectivas na biologia de plantas com ênfase nos estudos de variabilidade genética, estresses fisiológicos e desenvolvimento de plantas. Palavras-chave: prote?mica, análise de proteínas, interat?mica, plantas. ABSTRACT The implementation of mass spectrometry (MS) for peptides (MS) and amino acids (tandem MS or MS/MS) analysis allowed the identification of hundreds of proteins in single experiments. A number of different strategies are current available for sample fractioning and purification, proteins identification, quantification, post-translational modifications (PTM) and interaction analyses. In this way, the proteomics open up new perspectives in plant biology with emphasis on studies of genetic variability, physiological stresses and pla