3分子变异及生态学问题.pptVIP

分子变异与生态学问题;1、分子变异;1.1　基因突变种类;图中(a)表示基因原序列；(b)表示基因序列中从C到T的转换；(c)表示基因序列中从G到C的颠换；(d)表示缺失序列ACCTA；(e)表示插入序列AAAGC；(f)表示DNA双链中GCAAC互补碱基对发生倒位。;1.1.1　核苷酸替换;;转换和颠换如发生在基因的蛋白质编码区内，根据点突变对基因转录和蛋白质翻译产生的影响定性， 可以把点突变分为同义突变(synonymous mutation)和非同义突变(non-synonymous mutation)二种。 同义突变，碱基替换不引起氨基酸改变，则称为又称为中性突变(neutral mutation)或沉默突变(silent mutation)。同义突变的原因是点突变发生在密码子的第三个核苷酸，由于遗传密码的简并性，这个突变后的密码子恰恰同突变前的密码子编码同一氨基酸，这样，突变不会改变蛋白质中的氨基酸序列。引起编码氨基酸改变的碱基替换又称为非同义替换。 非同义突变，又进一步分为错义突变(missense mutation) 和无义突变(nonsense mutation。错义突变是指受到影响的密码子变成另一种新密码子，编码一个新的氨基酸，使氨基酸序列发生变化。错义突变大多发生在密码子的第一位或第二位核苷酸。无义突变是指一个编码氨基酸的密码子，在点突变后变成了一个终止密码子，使多肽合成提前中止，产生了缺失原有羧基端片段的缩短的肽链。在多数情况下，这种截短尾巴的蛋白质片段是没有活性的。;图6-3　发生在编码区的基因突变 (a)同义突变；(b)错义突变；(c)无义突变;1.1.2　插入和缺失;图6-4　滑脱误配所产生的重复和缺失 DNA复制期间TA重复中发生的两碱基滑脱。3‘-5’方向的滑脱造成一个TA重复单位插入(左半图)；5’-3’方向的滑脱造成一个未配对TA重复单位缺失(右半图)，该TA重复单位的缺失可能是由于DNA聚合酶3‘-5’外切酶的活性所致。 ;图6-5 基因中的不等价交换 图中矩形表示某一特定长度的DNA。不等价交换，导致其中一个子链中某一DNA序列缺失，而另一子链中则出现同一序列的重复。 ;　　缺失和插入统称为裂缝(gaps)，因为当一个带有缺失或插入的序列与原序列比较时，两序列中就会出现一个裂缝。裂缝事件中所涉及的核苷酸数目，范围从一个，几个或数千个核苷酸连续片段。 　　裂缝的长度基本上展示出双峰型频率分布，短裂缝(1—30个核苷酸)常常是由于复制过程中的错误造成的，如上面所讲的滑脱链误配；而长片段的插入和缺失主要是由于不等价交换和基因转座造成的。;1.1.3　移码突变;图6-6　移码突变 (a)缺失一个G，造成翻译提前终止；(b)插入一个G，结果去掉一个终止密码子，造成翻译长度增加。终止密码子下划有横线。;1.2 突变的空间分布;1.3 基因突变和自然选择;;　　基因突变是不定向的，随机的；也就是说，突变的效应并不对应于诱变因子的性质。比如，低温并不引起抗寒的突变，使用青霉素并不引起抗青霉素的突变。可是，在低温条件下，的确可以找到抗寒的作物；用青霉素后，有些细菌确是出现了抗药性。其原因是低温和青霉素在这里充当一个选择因子。在自然界的生物群体中，每一个个体对温度或青霉素的耐受个体本来就是不同的。正常温度或不接触药物的环境中，耐低温或耐药物的性状没有表现，因为没有表现的环境。可是，当温度降低或使用药物时，不耐低温或药物或耐受程度较差的个体无法生存而被淘汰，只有耐低温或耐药的个体能够生存而被选择，并逐渐成为群体中的主体，于是出现了耐低温或耐药的生物群体。如果温度再降低，青霉素的剂量再增加，则只有耐受性更高的个体被选择保留下来，并形成一个群体，于是出现了温度不断降低，青霉素剂量不断增加，生物体更能耐低温和耐药物。因此，突变是不定向的，只有选择是定向的。群体基因型的定向变异，是由选择作用造成的，而不是个体的定向变异造成的。;;;1.4 动态突变;;1.5 DNA 分子变异的异质性;;如何检测发生在不同个体之间的这种分子变异？;2、 检测分子变异的技术;2.2 DNA-DNA 杂交;2.3 限制性片段分析;2.4 DNA 指纹分析;;;;2.4 PCR;;2.6 DNA 测序;2.7 变性梯度凝胶电泳;2.8 随机扩增多态性DNA（RAPD）;3 生态学应用;3.1 性别鉴定;;3.2 交配制度;3.3 种群结构;3.4 迁移和基因流;3.5 渐渗现象与杂交地带;3.6 物种的鉴定;3.7 分子系统学;3.8 群落多样性