- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
1、EST数据分析平台的构建
EST数据分析平台的构建;功能分类及代谢途径分析;一、硬件介绍:
1、个人电脑(PC机)
2、PC Cluster(集群)
3、小型服务器
4、大型机
二、Unix操作系统及其常用命令简介(man、ls、cd、more、rm、mkdir、chmod、gzip、tar)
三、常用EST数据分析软件的安装:
例:1、BLAST
2、ClustalW
3、InterProScan
4、Perl;一、硬件介绍; 1、个人电脑(较少数据,简单运算):
EST分析所需的基本配置:
? 处理器:1.7G CPU;
? 内存:518MB以上;(BLAST:4000条EST与nt库比对,30MB)
? 硬盘:50GB以上;
; 一组完整的计算机互联,作为统一的计算资源一起工作,并有一台机器的印象。
;优点: 自由组装,良好的可扩展性;
性价比高;
抗突发性;
速度快。
缺点: 不够稳定。
; 品牌:IBM、 HP、 SUN、Intel、DELL、曙光、浪潮、联想、方正等。
外形:塔式、机架式、刀片和机柜式。 ; 选购标准:
(1)稳定性能(最重要)
(2)针对性原则
(3)够用原则
; 低档配置 中档配置 高档配置
CPU Xeon DP 2.6G*1 Xeon MP 3.0GHz*1 Xeon MP 3.0GHz*2
Opetron 2.0G*1 Opteron 2.6G*2
(Intel) 缓存:512KB 缓存:1024KB 缓存:8192KB
(AMD) 1024KB 1024KB
内存(标准) 512MB 1024MB 1024MB*2
(最大) 4096MB 30786MB 30786MB
(工作频率)133MHz 266MHz 400MHz
硬盘 73G*2 73G*2 0
价格 7000-10000元 14000-16000元 20000-40000元; 3、小型服务器(数据安全);缺点:
◆ 价格较高;
◆ 操作系统、设备和部件比较专用,用户
本身维护困难;
◆ 可扩展性不强。;
一般指system/360 开始的一系列的IBM计算机;也可以指其他厂商制造的兼容系统。
特点:并行性;
软硬件协同。;IBM eServer p690; 优点:高可靠性;
高可用性;
高服务性。
缺点:设备昂贵;
维护困难;
可扩展性不强等。
;;二、Unix/Linux及其常用命令简介; 1、Unix概述:
功能强大的操作系统,管理计算机资源。
典型的服务:执行新程序;
打开文件;
读文件;
分配存储区等。; 2、不同风格的Unix:
1) Linux:
① 自由软件(免费、修改、传播);
② 具有Unix的全部功能;
③ 对硬件要求低;
④ 稳定。
比较流行的版本:Red Hat Linux、 Turbo Linux 、Slackware Linux、SuSe Linux。;主要特点:
(1)开放性;
(2)多用户;
(3)多任务;
(4)良好的可移植性;
(5)可靠的安全系统 :对读、写控制、带保护
的子系统、审计跟踪、核心授权等。 ; 2)其他常见的Unix版本:
文档评论(0)