靶向基质金属蛋白酶14类血红素结构域特异活性位点的确定及反义肽虚拟筛选.pdfVIP

? 技 术 通 讯 ? ? ? ??，????????? ??????????????????．??????·． ?????．??????? ???? ???：??．?????．????．?????????．????．??．???? 研究报告? 靶 向基质 金属 蛋 白酶 ??类血红 素 结构 域 特异活 性位 点 的? 确 定及反义肽虚拟筛选? 谭博文，周毅洁，黄婷婷 ，茆灿泉? 西 南交通大 学 生命科 学与工程 学院分子进化 与应 用生物学实验 室 ，四川 成都 ??????? ?摘 要 ?? 目的 ：确定 基 质 金属 蛋 白酶 ??????一???类 血 红素 结构 域 ???????特 异 活性位 点 ，虚 拟筛 选获 得 能 与? ?????特异结合 的短肽 。方法 ：用 ??????????预测 ?????的活性 口袋 ，多序列 比对 分析活性 口袋 的氨基酸残基特异? 性；基于 ?—?和?— ?理论设 计 以特异活性位点为正义肽 的反 义肽 库，并进行虚拟筛研 究及结合特异 性确定 。结果 ：生? 物信息 学分析确定 了???????为 ?????的特 异活 性位 点 ，并构建 了其 ????条 反义肽 ；通过 ?轮虚拟筛选 ，获得 ??? 条得分居 前的与 ?????结合较好 的反 义肽 ，它们 与?????具 有较高的亲和力 ，并可能影响 ???一??同源二聚体 的形? 成 和 ???一??活性 的抑制 ；???????、???????是 对接 打分 最好 的 ?条 短肽 ，与?????的结合 具有 特异 性。结论 ：? ???????是 ?????的特 异活性位 点 ，虚拟 筛选得 到的???????、???????等反义肽 与 ?????具有较 高 的亲和 力，?