基于免疫与神经网络的 RNA 二级结构预测.pdfVIP

第 ??卷第 ?期? 湖 北 科 技 学 院 学 报? ???．??，??．?? ???????????????????????????????????????????? ??????? 年 ? 月? ?— ??— ???．????? 文章 编 号 ：?????????????????— ????—??? 基 于免疫与神经 网络 的 ???二级结构预测? 林 航 ，李金 铭? ?福建农林大学，福建 福州 ???????? 摘 要：???二级结构预测是生物信息学领域的一个热点问题，通过计算机仿真模拟和数学建模计算来“预测”? 这些结构信息，具有较好的参考价值 以及可信度，并能够节省大量的时间与成本。本文通过改进传统的 ???二? 级结构预测算法，提 出了混沌 ??????神经网络算法算法。算法以茎区作为神经元，同时采用相似距离函数、对? 神经元 的初始值进行优化 ，在 获得初步结果后 ，通过使用混沌 函数优化 结果 ，使得其跳 出局部 最优 解 ，提 高 了全局? 搜 索能力 ，能简单、快速规 范的获 得最优 解。仿真结果表 明 ，本 算法 能够有 效 的对 ???二级结 构进行 预测 ，有较? 好 的 的预 测 效 果 。? 关键 词 ：免疫 算法 ；???????神 经 网络 ；???二 级结构 ；预测? 中图分类 号 ：????；?????．?? 文献标识码 ：?? 脱氧核糖 核酸具有 重要 的生物学功能 ，是 ???到蛋 白? 一 般指的是通过随机确定性方程获得 的随机性 运动状? 质间遗传信息 中间传递 体 ”?。???二级 结 构是 特定 平 面? 态 ，混沌状态变量 被称 为混沌 变量 。????????映射 是是一 个? 图 ，配对 的部 分构成局 部 的双螺旋 结构 ，这就 是 ??? 的二? 常用的混沌系统 ，方程 如下 ：? 级结构??，它是一 种 平 面的结 构 。 目前 ，使 用 实验 方 法 在? ???／?????一? ?? ???，?，? ?? ???? ???信息数据的惊人的增长下，实现生物分子的具体的二? 式???是一个动力学系统 ，肛作为其控制参数。? 值确? 级结构有着其 自身 的局 限性 ，而且 对所有 分子 并不 是都 有? 定后 ，从任 意的初值 ??????，??，可以迭代得 到一个确