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第9章微生物的分类和鉴定
Chapter 9
Classification and identification of microbes
第九章
微生物的分类和鉴定
;定义:按微生物的亲缘把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。
任务:分类、鉴定、命名;第一节 通用分类单元;一、种的概念;二、微生物的命名;微生物的名字有俗名和学名两种。如:
红色面包霉———粗糙脉孢霉
绿脓杆菌———铜绿假单胞菌
学名—是微生物的科学名称,它是按照有关微生物分类国际委员会拟定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。学名的命名有双名法和三名法两种。
①双名法:
学名=属名+种名+(首次定名人)+现定名人+定名年份
必要,用斜体表示 可省略,用正体字
属名:拉丁文的名词或用作名词的形容词,单数,首字母大写,表示微生物的主要特征,由微生物构造,形状或由科学家命名。
种名:拉丁文形容词,字首小写,为微生物次要特征, 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。;例:大肠埃希氏杆菌
Escherichia coli (Migula)Castellani et Chalmers 1919
金黄色葡萄球菌
Staphylococcus aureus Rosenbach 1884
;菌株名称——在种名后面自行加上数字、地名或符号等,如:
Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinica
Bacillus subtilis BF7658 BF=北纺
Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌
ATCC =American Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心
当文章中前面已出现过某学名时,后面的可将其属名缩写成1~3个字母。
如:Escherichia coli 可缩写成 E. coli
Staphylococcus aureus可缩写成 S. aureus
②三名法:用于对亚种的命名,这时在属和种名后加写一个subsp.,然后再附上亚种名称(斜排体)。 如:
Bacillus thuringiensis subsp. galleria
苏云金芽孢杆菌腊螟亚种 ;三、亚种以下的分类单元;第二节 生物在自然界的地位;一、三原界系统示意图;第三节 各大类微生物的分类系统纲要;第四节 微生物分类鉴定的方法;一、数值分类法;主要观点:
在一个分类群中,其所含信息量越大,即分类所依据的性状越多,其分类效果也越好;
顺序建立自然分类单元时,每个性状都是等权的;
任何两分类实体间的整体相似性,都是由每一对的相似性计算而来的;能够由类群间相似性的差异识别不同的分类实体;
如果给予有关进化途径和机制的某些假定,可以从组群的分类学结构或从性状相关上作出种系发生的推论;
分类学应作为一门经验科学来看待和实践;
数值分类学是以表象相似性为基础的。
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