计算机在材料科学与工程中的应用-3.1选编.ppt

第三章 计算材料学-第一性原理;实验有冲突选不上的， 联系李延波老师 135 4173 0300 ;1. 材料计算模拟的层次及对应的方法；(了解) 2. 利用 Visualizer建立材料模拟中的各种物理模型-能建立晶体、表面、层结构、掺杂和高聚物图形模型；（重点） 3. 密度泛函理论及其在Castep模块中的实现；（难点， 了解） 4.Castep模块在第一性原理计算模拟中的应用-计算材料的晶格常数、能带、态密度、电荷密度等。（重点）;一、材料计算模拟的层次及对应的方法;计算材料学是沟通理论与实验、微观与宏观的桥梁。; 计算材料学是利用现代高速计算机，模拟材料的各种物理化学性质，深入理解材料从微观到宏观多个尺度的各类现象与特征，并对于材料的结构和物性进行理论预言，从而达到设计新材料的目的。;计算模拟及设计在材料研究中的重要性;材料研究中的尺度（时间和空间）;空间尺度/m;空间尺度/m;空间尺度/m;;;;; 对于材料的性质，常由几个层次的结构来决定，因而近年来将不同方法结合起来的跨尺度方法受到广泛的重视。;;二、Materials Studio (Visualizer)应用;要求： 了解 Visualizer的窗口组成及功能； 能从数据库导入结构，并进行修改； 能绘制有机分子，并进行简单操作； 能根据文献数据绘制出晶体； 能构建表面等结构；;;菜单栏;3. 改变3D结构的视图;从数据库导入结构;BaTiO3晶体结构;更改显示方式：;绘制有机分子;下面建造苯甲酰胺结构：;2. 设置球棍模型为默认显示方式 从菜单栏中选择 Modify / Default Atom Style ，打开 Default Atom Style 对话框。在Display Style中选择Ball and stick 。单击 Close button ???? 关闭 Default Atom Style 对话框。 这样在本project 中，默认显示方式被设置为 ball and stick。 ; 此时按下 ALT key ，单击鼠标左键，则出现一个具有 with resonant bonds 的芳香环(aromatic ring)。; Sketch Atom 按钮 可以画任意元素的原子，默认画碳原子。下面要将双碳原子侧链接到环上。 在绘图工具栏(Sketch toolbar) 上单击Sketch Atom 按钮 ，松开，然后鼠标移动到环的3D文档中，这时鼠标看起来象一只“铅笔”。将“铅笔”移到环的一个碳原子上，这个碳原子变蓝。左键???击此碳原子，将键连接到该原子上。移动“铅笔”并在3D的合适位置单击左键，设置另一个碳原子。键自动加在此碳原子与环之间。将“铅笔”移到另一位置，双击左键，又画出一个碳原子。这样就作出了连到碳环上的一个双碳原子链。 另一种终止链延续的方法：在3D的某一合适位置单击左键，画出最后一个碳原子，然后 按一下键盘上的ESC 键即可。化学键 自动加在新画的碳原子之间。 注意，对错误操作，可用工具栏上的Undo按钮 取消。;4. 绘制氧原子 单击 ，则 激活。在其下拉选项中，选择Oxygen。将鼠标移到侧链的第一个碳原子上，这个碳原子变蓝。左键单击此碳原子，将键连接到该原子上。移动鼠标并在3D的合适位置双击左键，这样设置了一个氧原子，终止了链的延续。;5. 编辑原子类型; 总之，首先选择两个原子之间的键，然后在Sketch 工具栏上的Modify Bond Type 按钮来改变键的类型，同样的选项也可以在Modify 菜单下的Modify Bond Type 中找到。 如果要选择多个原子或键，请按下Shift 后再进行选择。如要取消选择，请在结构外单击鼠标左键。;7. 调整氢原子并进行整理;9. 监控和调整原子间距离;* 可以用Materials Studio窗口左侧的Properties Explorer 看分子的信息;观察并且处理研究表格文档 目的： 介绍Materials Studio 中研究表格(study tables ) 的概念。 模块： Materials Visualizer 前提： 已建立一个 project;1. 打开一个新的研究表格文档 从File 菜单中选择New，单击New打开 New Document 对话框， 选择 Study Table， 单击 OK 按钮。 或者在常规工具栏上选择New，甚