几种模式生物基因组中最适密码对和稀有密码对使用的规律性.pdfVIP

第 ?卷 第 ?期? 生 物 信 息 学? ???．????．?? ???????年 ???月? ???????????????????????????????? ???．。????? ???：??．????／?．????．????— ????．????．??．??? 几 种 模 式 生物 基 因组 中最 适 密 码对 和 稀 有 密 码? 对 使 用 的规 律 性? 王芳平 ，王志坚? ?天水师范学院物理与信息科学学院物理系，甘肃 天水 ???????? 摘 要 ：以 ?种模式生物基 因组为样本 ，从密码 对的碱 基组 成及 密码 子 的使 用两方 面，分 析 了最适 密码对 与稀 有 密码对 的使? 用。结果显示：?种生物的最适密码对 ??双碱基 ??出现的频数都是最低的，而出现频率最大的双碱墓对于古菌、细菌、真核? 是不同的；稀有密码对中双碱基 ??出现的频数却是最高的，而出现频率最低 的双碱基刘 · 于古菌、细菌、真核是不同的。这? 说 明双碱基 的分布 与密码对的偏 好性有很 强的相关性，同时也 与基 因组进 化存在关联 。另外，我们 也分析 了本 文的 ?种生物? 编码序 列叶，最适 密码对 与稀有 密码对 的出现频数 与密码 了的相对使用 频率 的关系，发现 密码对 的出现频数与其 密码 子 的使? 用存在相 关性。? 关键词 ：：密码对 ；双碱 基 ：密码子 的相对频 率；基 因组? 中图分类号 ：???? 文献标识 码 ：?? 文章编号 ：????— ??????????一??— ???— ??? ???????????????????????????????????????????????? — ?????????????? ????????? ????????? ??????????????? ?????????— ????，????????— ????? ???????????????????????????????????????，???????????????????????，????????????，?????????????? ????????：????????????????????