家鹅线粒体细胞色素b的同源建模与结构分析.pdfVIP

长 江 大 学 学报 ?自然 科 学版 ?? ????年 ?月号农学中旬刊 第 ??卷 第 ??期? ????????????????????????????? ??????????????? ???．????，???．?????．??? 家 鹅 线粒 体 细胞 色素 ?的 同源 建模 与 结构 分 析? 陈艳荣? ?黄山学院生命与环境科学学院，安徽 黄山???????? 王继文 ?????农业大学动物科技学院，四???雅安????????? ?摘 要 ? 为 了解 家 鹅 ????????????????? 线 粒 体 细 胞 色 素 ?在 电子 传 递 链 中 的复 杂 功 能 ，通 过 测 得 ??个 ??? 国 家 鹅 ?????????????????????? 品 种 和 ?个 欧 洲 鹅 ?????????????????? 品 种 的 细 胞 色 素 ?基 因全 序 列 ，? 利用 序 列分 析 软件 推 导 出相 应 的 氨 基 酸 序 列 ；使 用 同 源 建 模 法 构 建 了细 胞 色 素 ?蛋 白高 级 结 构 ， 并 对 该? 结构 进 行 分 析 。 结果 表 明 ： 预测 结构 包 含 ?个 较 大 的 跨 膜 ?螺 旋 ， 它们 被 ?个 长 的松 散 结构 和 ?个 短 的 易? 变 区连 接 在 一 起 ， 另 外 还 有 ?个 较 小 的 螺 旋 ，?个 小 的 ?一折 叠 片 层 ；该 结 构 表 面 静 电势 比 内部 高 ，分 子 表? 面存 在 ?个 洞 穴 ， 一 大 一 小 ； 经 过保 守 区的 查 找 ， 发 现 此 结 构 存 在 ?个 结 构 域 ，分 别 为 ?????— ?，????? ?，??结 合 部 位 、?? 结 合 部 位 、??结 合 部 位 和 ??结 合部 位 等 ?处 活 性 位 点 被 初 步 定 位 。? ?关键词?家鹅 ?????????????????；细胞 色素 ?；同源建模 ；三级结构 ；活性位点? ?中图分类号?????? ?文献标识码 ??? ?文章编号?????— ???? ????????— ????— ??? 线 粒体 细胞 色素 ? ???????是构 成线 粒体 细胞 色素 ???复合 体 的蛋 白质之 一 ，也是 其 中唯一 由线 粒? 体 基 因组 编码 的蛋 白质 ，它转 移 ?种 不 同形 式 的血 红 素 ：高 电位 式 ????和 低 电位 式 ????。这 些 血? 红素分 别位 于线 粒体 内膜 的 内侧 和 外侧 ，形 成 了辅 酶 ? 的 ?个 氧化 还 原位 点 ??。、??? 间 的跨膜 电子? 循 环?】???。 目前 对 于 ?????在 电子 传递链 中的复 杂功 能仍 不尽 清楚 ???。?????是一 个横 贯膜 两侧 的极 端 疏? 水 性 的蛋 白，与 线粒 体 内膜结 合极 为 紧密 ，很难 将其 单 独 分 离???。 由于具 有 较 强 的疏 水 性 ，不 易 结 晶 ，? 采 用 常规 的晶体 学方 法研 究其 结构 和功 能效 率较低??。 同源 建模 ?比较建 模 ?是 目前唯 一能 够从 蛋 白质? 的氨基 酸序 列 ?目标 序列 ? 出发 ，建 立 ??模 型 的计 算 方法 ???。蛋 白质 的结 构 比蛋 白质 的序 列 更 保 守 ，? 如果 ?个蛋 白质 的氨基 酸 残基序 列有 ??? 相 同 ，那 么约 有 ??? 的 ?碳原 子 的位置偏 差 不超 过 ?? 。这是? 同源模 型化 方法 在结 构预 测方 面成 功 的保 证 ???。? 本 研究 通过