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《DNA的粗提取及鉴定》实验中的两个常见问题
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《DNA的粗提取和鑑定》實驗中的兩個常見問題
陶曉東(江蘇省常州市武進高級中學生物組 213161)
要點:實驗中提取DNA的實驗材料的選擇問題,幾種實驗材料各自的優缺點;DNA鑑定過程中容易出現的一些常見問題及具體的解決方案。
此實驗比較複雜,在實際操作過程中需要注意的細節問題也非常多,而且往往因為某個環節的操作不當,結果不能觀察到明顯的實驗現象。因此,有必要對實驗過程中應當注意的問題做一些探討。從我個人和學生的實際實驗操作過程中,我認為有以下兩個問題值得注意。
實驗材料的選擇問題:
雖然各種生物細胞中都含有大量的DNA,但是並不是每一種生物組織都適合做提取DNA的原材料。比較好的實驗材料最好應該滿足以下幾個條件
組織中DNA的含量比較豐富,能夠適合大量提取。
該組織中所含化合物種類應比較單純,避免由於其他物質化學性質與DNA相近,從而對實驗現象產生某些干擾。
實驗材料的價格適宜,從而能相對的降低實驗成本。
實驗材料在實驗過程中的可操作性較強,在相對簡單的條件下能大量提取出DNA,便於學生實驗操作。
可用於提取DNA的實驗材料很多,例如:雞血、植物組織(新鮮菜花、蒜黃、菠菜等)、魚類的精巢,甚至是從動物胸腺中提取DNA。這幾種實驗材料由於各自性質的差異,實驗的操作過程和步驟有很大的差別,以下是四種實驗材料特點的粗略比較。
實驗成本DNA含量特殊藥品配置實驗儀器配置實驗效果雞血細胞取材易,價格較低豐富檸檬酸鈉離心機 可操作性強,實驗效果明顯植物組織易取材,價格較低較豐富SDS (十二烷基磺酸鈉)
EDTA (乙二胺四乙酸二鈉)
三羥甲基氨基甲烷常規實驗成功率較低,實驗效果與磨研液關係密切?,魚類精巢取材易,價格較低豐富無組織搗碎機可操作性強,效果明顯,但不易定量控制動物胸腺取材不易,價格高豐富檸檬酸鈉離心機
組織搗碎機可操作性較強,適宜做定量分析根據以上對比可以看出,???果從取材方面來考慮的話,以動物胸腺組織作為實驗材料是不經濟的,而且還要面臨中學實驗條件的限制等問題。我沒有具體完成過該實驗,如果有興趣的話,該實驗的實驗方法可查閱相關資料。
使用其餘三種物質作為實驗材料,學生的操作過程大同小異,具體資料可能會有一定的差別,以下是三種不同方法步驟的比較:
雞血細胞植物組織魚類精巢配質量濃度為0.1g/ml的檸檬酸鈉溶液,按1:2的比例與新鮮雞血混合攪拌均勻。
將血液倒入離心管中,在1000r/min的轉速下離心2~3分鐘,棄上部澄清液。
取離心管底部的血細胞液約5~10ml加入到100ml燒杯中,向燒杯中加入20ml蒸餾水,用玻棒沿一個方向快速攪拌5分鐘,加速血細胞在低滲溶液中的破裂。
將50ml 10%的氯化鈉溶液緩緩倒入燒杯中,用玻棒沿一個方向攪拌,此時DNA溶解於氯化鈉溶液中,濾除雜質,獲得粘稠狀的雞血細胞DNA提取液。
將雞血細胞DNA提取液置於較大的燒杯中,沿燒杯內壁緩緩倒入蒸餾水,並不斷攪拌,直到粘稠狀DNA不再析出為止。用玻棒攪拌,使析出的DNA纏繞於玻棒末端。為減少DNA的損失,可省略使用塑料紗布過濾這一步驟。
將析出的DNA再溶解於20ml 10%的氯化鈉溶液中。
在DNA的氯化鈉溶液中倒入95%的酒精50ml(冷卻過的酒精效果較好),使DNA再次析出,用玻棒攪拌,使DNA再次纏繞於玻棒末端。
DNA的鑑定:取兩支試管,各加入2ml 10%氯化鈉溶液,將DNA溶解于其中一支試管中,另一支做為對照組。然後,在兩支試管內加入相同的量的二苯胺試劑,水浴加熱10min左右,冷卻,觀察實驗現象。取新鮮植物組織(菜花)放置於冰箱中冷卻1~2天。
取30克植物組織,切碎,置於研體中,倒入10ml磨研液,充分磨研10分鐘。
將磨研液置於離心管中,在1000r/min的轉速下離心2~3分鐘,取上清夜置於冰箱中冷卻幾分鐘。
取1倍體積的上清液,加入2倍體積的95%的冷酒精當中,用玻棒輕輕攪拌,沉澱3~5分鐘後可見白色絮狀DNA纏繞於玻棒末端。
DNA的提純同雞血細胞為實驗材料的實驗操作步驟6、7,具體資料有一定的差異。
鑑定(略)。取成年雄性鯉魚1條,取出精巢10克,用組織搗碎機搗碎成糜。
組織糜溶於500ml 10%NaCl溶液中,用玻璃棒攪拌至凝膠狀。
取部分凝膠狀的DNA提取液進行DNA的提純,提純DNA的實驗過程同以雞血為實驗材料的實驗操作步驟6~7,具體資料有一定的差異。
鑑定(略)。從實驗的效果來看,使用魚類的精巢與使用雞血細胞沒有太大的區別,如果考慮實驗成本的話,兩者存在一定的差別。如果使用雞血細胞作為實驗材料,雞血細胞DNA提取液的儲備一定要充足,一般來說,每組學生(2人)需
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