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蛋白质的生物合成[翻译]
蛋白质的生物合成(翻译);蛋白质的生物合成过程,就是将DNA传递给mRNA的遗传信息,再具体转译为蛋白质中氨基酸排列顺序的过程,这一过程被称为翻译(translation)。
;第一节 蛋白质合成体系;20种氨基酸(AA)作为原料
酶及众多蛋白因子,如IF、EF、RF
供能物质(ATP、GTP)、无机离子;一、mRNA模板及遗传密码;; mRNA上的遗传密码;标准的通用遗传密码表;遗传密码字典;从mRNA 5?端起始密码子AUG到3?端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框(open reading frame, ORF)。 ;遗传密码具有以下特点:
① 连续性;
② 简并性;
③ 通用性;
④ 方向性;
⑤ 摆动性。;连续性(commaless)指编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。;基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生插入或缺失,可能导致框移突变(frameshift mutation)。 ;2. 简并性(degeneracy);遗传密码的简并性;3. 通用性(universal);4. 方向性(direction):;5. 摆动性(wobble);密码子与反密码子的摆动配对;U;核蛋白体是多肽链合成的场所,是由多种rRNA与蛋白质组装形成的复合体。;原核生物中的核蛋白体大小为70S,可分为30S小亚基和50S大亚基。小亚基由16SrRNA和21种蛋白质构成,大亚基由5SrRNA,23SRNA和34种蛋白质构成。
真核生物中的核蛋白体大小为80S,也分为40S小亚基和60S大亚基。小亚基由18SrRNA和30多种蛋白质构成,大亚基则由5S rRNA,28S rRNA和约50种蛋白质构成,在哺乳动物中还含有5.8 S rRNA。 ;核蛋白体的组成;大肠杆菌核蛋白体的空间结构为一椭圆球体,其30S亚基呈哑铃状,50S亚基带有三角,中间凹陷形成空穴,将30S小亚基抱住,两亚基的结合面为蛋白质生物合成的场所。 ;1.与模板mRNA和起始tRNA结合位点:主要与小亚基有关。
2.三个不同的tRNA结合位点:
⑴A位:又称受位或氨酰基位,可与新进入的氨基酰tRNA结合;由大、小亚基成分构成。
⑵P位:又称给位或肽酰基位,可与延伸中的肽酰基tRNA结合;由大、小亚基成分构成。
⑶E位:又称排出位,空载tRNA脱离核蛋白体前的结合位点;主要由大亚基成分构成。;3. 转肽酶活性:将给位上的肽酰基转移给受位上的氨基酰tRNA,形成肽键;由大亚基成分构成。
4. GTPase活性:水解GTP,获得能量;分别由大、小亚基成分构成。
5. 起动因子、延长因子及释放因子的结合位点:分别由大、小亚基成分构成。;原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式;在蛋白质生物合成过程中,常常由若干核蛋白体结合在同一mRNA分子上,同时进行翻译,但每两个相邻核蛋白之间存在一定的间隔,形成念球状结构。
由若干核蛋白体结合在一条mRNA上同时进行多肽链的翻译所形成的念球状结构称为多聚核蛋白体(polysome)。 ;多聚核蛋白体示意图;氨基酸臂;tRNA的三级结构示意图;氨基酸的活化与携带反应由氨基酰tRNA合成酶催化。
特定的tRNA与相应的氨基酸结合,生成氨基酰tRNA,从而由tRNA携带活化的氨基酸参与蛋白质的生物合成。; tRNA与酶结合的模型;氨基酰tRNA合成酶催化的反应:;第二步:连接反应;氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。
氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proof-reading activity) 。
氨基酰-tRNA的表示方法:
Ala-tRNAAla
Ser-tRNASer
Met-tRNAMet ;能够识别mRNA中5′端起始密码AUG的tRNA是一种特殊的tRNA,称为起始tRNA。
在原核生物中,起始tRNA是一种携带甲酰蛋氨酸的tRNA,即fMet-tRNAifmet;而在真核生物中,起始tRNA是一种携带蛋氨酸的tRNA,即Met-tRNAimet。
在原核生物和真核生物中,均存在另一种携带蛋氨酸的tRNA,识别非起动部位的蛋氨酸密码AUG。 ;与多肽链合成起始有关的蛋白因子称为起始因子(initiation factor,IF)。
原核生物中存在3种起始因子,分别称为IF1-3。在真核生物中存在9种起始因子(eIF)。
IF的作用主要是促进核蛋白体小亚基与起始tRNA及模板mRNA结合。 ;原核和真核生物中各种起始因子的生物功能;与多肽链合成的延伸过程有关的蛋白因子称为延长因子(elongation factor,EF)。
原核生物中存在3种延长因子(EFTU,EFTS,EFG),真核生物中存在
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