第五章 核酸分子杂交.pptVIP

核酸分子杂交（DNA/DNA or DNA/RNA）;核酸分子杂交技术： 具一定同源性的两条(DNA或RNA)单链在适宜的温度及离子强度等条件下, 可按碱基互补配对原则特异性地复性，形成双链。; 核酸分子杂交技术，是在1968年由华盛顿卡内基学院（Carnegie Institute of Washington）的Roy Britten及其同事发明的。所依据的原理是，带有互补的特定核苷酸序列的单链DNA或RNA，当它们混合在一起时，其相应的同源区段将会退火形成双链的结构。 ;核酸分子杂交的基本原理;;;影响杂交的因素;分子杂交的基本方法;Southern DNA印迹杂交;Southern DNA印迹杂交 使在电泳凝胶中分离的DNA片段转移并结合在适当的滤膜上，然后通过同标记的单链DNA或 RNA探针的杂交作用检测这些被转移的DNA片段，这种实验方法叫做DNA印迹杂交技术。由于它是由英国人Edwin Mellor Southern于1975年首先设计出来的，故又叫Southern blot。 ;Southern 杂交(Southern bloting)的主要步骤;（a）;DNA凝胶电泳;;;;;;Southern DNA 印迹杂交之X光显像图片 水稻（Oryza sativa L.)的叶绿体DNA分别用核酸内切限制酶BglⅡ(A-C)、BamHⅠ（D-F）、EcoRⅠ（G-I）、和HindⅢ（J-L）消化，加样在含有EtBr染料的1%的琼脂糖凝胶电泳中作电泳分离，然后同32P标记的玉米psbA探针作Southern杂交。X光底片中显现的阳性条带 ，表明含有水稻的psbA基因序列;利用非放射性探针检测核苷酸;;Northern blot;Northern杂交;;Northern印迹与Southern 印迹的不同点 1、变性：RNA电泳前加热变性、电泳时加变性剂保 持RNA处于变性状态，DNA电泳前和电泳 中不变性; 2、转膜：RNA转膜前不需变性和中和处理,Southern 印迹时，DNA转膜前需进行碱变性及中和处理 3、靶核酸为RNA;;Western 杂交印迹法(Western bloting);;In Situ Hybridization;原位杂交(in situ hybridization);原位杂交 1、定义：将标记的核酸探针与固定在细胞或组织中的核酸进行杂交，称原位杂交。根据检测物分细胞内原位杂交和组织切片内原位杂交；根据探针与待检核酸分：DNA/DNA、RNA/DNA、RNA/RNA 杂交 ; 保持组织细胞的形态 对核酸无抽提，修饰与降解作用 不改变核酸在组织细胞内的定位 不阻碍核酸与探针的杂交过程 对杂交信号无遮蔽作用 理化性质稳定 ;（2）组织细胞杂交前的预处理;（3）探针的选择与标记;（4）杂交;（5）杂交结果检测;;;斑点及狭缝印迹杂交 1、斑点印迹为圆形 2、狭缝印迹为线状 3、鉴别DNA、RNA 4、简单、快速，同一张膜可检测多个样品 5、特异性不高、不能鉴别核酸分子量;斑点印迹杂交(dot bloting);;液相杂交 指待测核酸和探针都存在于杂交液中，碱基互补的单链核酸分子在液体中配对形成杂交分子的过程。;（一）RNA酶保护分析法;2、杂交过程;（二）核酸酶S1保护分析法 1、原理 核酸酶S1在一定条件下专一水解杂交体系中的单链DNA和单链RNA，不水解DNA探针与待测RNA杂交形成的杂交体，使杂交分子得到保护，称核酸酶S1保护分析法;2、杂交过程;核酸杂交的探针 ;(1)常用探针类型： ①人工合成寡核苷酸探针 ②基因组DNA探针 ③cDNA探针 ④RNA探针; (2)探针标记物 ①放射性标记物 32P 高放射性 半衰期14.3 d 35S 放射性较弱 半衰期87.1 d 3H 放射性弱 半衰期12.35 a ②非放射性标记物 半抗原：生物素、地高率 配体：生物素是亲和素的配体 荧光素：异硫氰酸荧光素、罗丹明等