新型耐药基因传播元件：ISCR.docVIP

　　新型耐药基因传播元件：ISCR 【摘要】 随着抗生素的广泛使用和滥用，细菌的耐药问题日益严重。转座子和整合子可以解释大多数耐药基因在DNA分子间的移动，但它们不能解释耐药基因移动的实质和耐药基因亚种的增长。本文介绍一类传播耐药基因元件——ISCR，并阐明抗生素耐药基因广泛传播的实质。通过借鉴近几年来国内外研究的成果，概括论述ISCR因子与各类抗生素耐药基因的关系，这对耐药基因传播研究具有一定的指导意义。 【关键词】 插入序列(IS)； 共同区域(CR)； 耐药基因 ABSTRACT ore serious gradually. Transposon and integron systems can interpret most of the movement of resistance genes betolecules, but they fail to reveal the spread of a substantial and groent of antibiotic resistance genes: ISCR element is introduced, and the nature of the inated. on regions)的基因相邻，且在第一类整合子之外但靠近一类整合子的3′保守末端，对这些CRs进行对比分析显示它们彼此相关聚集为一类特殊的插入序列，被认为是IS91like。IS91和类似的转座因子与插入序列不同，由于它们缺少末端反向重复序列(IRs:inverted repeats)，因此它们转移邻近耐药基因是通过滚环复制的形式进行的。它们转座邻近的DNA序列也与大多数IS因子不同［7］，可以由CR因子的单拷贝介导［8］。CRs是一类通过滚环复制(RCR:rollingcircle replication)转座的IS91like因子家族的延伸成员，CRs可以解释每一类抗生素转移的实质。 1 ISCR的特点 1.1 ISCR是类似IS91的转座因子 IS91家族共有8个成员，即IS91、IS1294、IS801、ISFn1及其两个亚种、IS92L和IS92R，其中对IS91、IS801和IS1294研究数据较多。IS91及其相关的转座因子IS801和IS1294是不寻常的，它们具有不同于其它普通转座因子的三个特点：①它们缺少许多插入因子中普遍存在的终端反向重复序列［9，10］；②IS91的转座机制不同于大多数转座因子，它们是通过滚环复制对邻近耐药基因进行转座(图1)［8］。由于转座因子初始复制的原因，每个因子编码的单个蛋白是同源转座，同时说明终止复制优先于最终转座重组［7］。 转座因子的转座是一个前进的系统，oriIS是转座因子的一个终端，且作为复制的起点；terIS是IS91、IS801和IS1294的另一端，是复制的终点。oriIS序列可表示为5′GxTTTTxAAATTCCTATxCAT3′，位于IS91和IS1294中转座基因下游大约300bp处，位于IS801转座基因的下游179bp处。在CR序列下游240～250bp处具有与oriIS序列十分相似的连续序列(5′GCGTTTGAACTTCCTATACxx3′)。在这个基础上，假如CR编码的蛋白质存在可能的同源性，那么CR序列的末端是滚环复制起点的结论就是合理的。因此，CR序列具有与相似位置IS91like因子的两个主要特点，CRs是IS91like的转座因子。相应地，为了强调它们作为插入序列的同源性和它们被发现的 历史 ，我们假设它们是特定的ISCR因子。用来区分CRs的数字被保留下来以便区分不同的ISCRs，因此，CR1对应 图1 IS1294滚环复制机制ISCR1，CR2对应ISCR2，等［1］。 IS91、IS801和IS1294都保留着IS91的第三个特点是terIS，位于IS91和IS1294转座酶基因起点的上游大约300bp处，位于IS801转座酶基因起点的上游101bp处［8］。复制终止子序列terIS是一个25或26bp长度的序列，包含一个完整的六核苷酸反向重复序列和四核苷酸终止序列(5′GTTC3′)。ISCR2的terIS因子与IS91基团的terIS因子相似，有一个小的反向重复序列，但与IS91的6bp相比，仅有4bp。ISCRs与IS91及其类似转座因子总的序列同源性大约50%［1］。 IS91的转座因子家族IS1294已经被详细的研究，研究结果显示，当滚环复制机制错误识别terIS和继续向前复制与terIS相邻的DNA时，IS1294可以移动邻近的序列(图2)。 计算 得出IS1294普通转座发生率高达1%～10%。IS1294显示了将耐卡那霉素基因从质粒pUB238