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低氧反应通路对骨髓基质干细胞多向分化能力的影响
上海交通大学医学院硕士论文
灭菌双蒸水,溶解后分装冻存。提前将水浴调至55℃备用。
4.2 、样品准备:
分别从4 周龄标记鼠(HIF-1αflox/flox 、VHLflox/flox )尾部末端切取1cm
的组织,在液氮中将组织充分研磨成粉末,并转移至1.5ml 的离心管中。
4.3 、抽提步骤:
4.3.1 、加入180ul Digestion Buffer和20ul Proteinase K ,震荡混匀1min,
置于55℃温浴1h,充分混匀,直至充分溶解;
4.3.2 、加入200ul BDBuffer ,充分混匀;
4.3.3 、加入200ul 无水乙醇,充分颠倒混匀;
4.3.4 、将吸附柱放入收集管中,用移液器将溶液和半透明纤维状悬浮
物全部加至吸附柱中,静置2min ,12000rpm 离心3min,倒掉
收集液中的废液;
4.3.5 、将吸附柱放回收集管中,加入500ul PW Solution,10000rpm 离
心30sec,倒掉收集管中的废液;
4.3.6 、将吸附柱放回收集管中,加入500ul Wash Solution,10000rpm
离心1min,倒掉收集管中的废液;
4.3.7 、将吸附柱放回收集管中,10000rpm 离心2min ;
4.3.8 、将吸附柱放入干净的1.5ml 离心管中,在吸附膜中央加入50ul
预热(60℃) 的Elution Buffer ,静置5min,10000rpm 离心1min,
将所得到的DNA 溶液置于-20 ℃保存用于后续试验。
5、 鼠尾基因鉴定:
5.1、聚合酶链反应:
5.1.1、引物合成 由美国阿拉巴马大学Clemens 教授提供引物序列,委
托上海Invitrogen 公司合成(表2 );
10
上海交通大学医学院硕士论文
表2 :定量PCR 引物序列
Table 2: Primers for QRT-PCR
目 的 产物大小 退火 循环
引物序列
基因 温度 数
HIF 5’-TGATGTGGGTGCTGGTGTC-3’ 312bp wild 57 30
5’-TTGTGTTGGGGCAGTACTG-3’ 350bp flox
VHL 5’-CTAGGCACCGAGCTTAGAGGTTTGCG-3’ 250bp wild 58 30
5’-CTGACTTCCACTGATGCTTGTCACAG-3’ 450bp flox
TSH 5’-TCCTCAAAGATGCTCATTAG-3’ 386bp 53 30
5’-GTAACTCACTCATGCAAAGT-3’
OST 5’-CAAATAGCCCTGGCAGAT-3’ 300bp 53 30
RBG 5’-TGATACAAGGGACATCTTCC-3’
5.1.2、取提取的DNA ,以此为模板进行PCR 反应,反应体系见(表3、4 ):
表3 :PCR 反应体系(VHL 、HIF)
反应物
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