转录组的研究技术方法及当前.pptxVIP

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  • 2017-05-11 发布于重庆
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转录组的研究技术方法及当前

转录组的研究技术方法及当前进展;什么是转录组?;为什么研究转录组?;研究转录组的基本方法;转录组的各个研究方法的特点;(2)SAGE法的特点;(3)MPSS法的特点;(4)高通量测序技术的特点;二代测序在转录组的研究上越来越普 遍, 大有替代先前的基因芯片(microarrays)和基因表 达系列分析技术(serial analysis of gene expression, SAGE)之趋势。由于测序深度的优势, RNA-seq更 能全面地揭示生物个体在特定时刻和特定组织的全 局基因表达情况, 如发现新的转录本、了解基 因表达量、挖掘单核苷酸的多态(single-nucleotide polymorphisms, SNPs)、选择性剪接(alternative splicing)和结构性变异(structural variation)。对于 序列信息有限的非模式生物, RNA-seq更偏重编码 区域。由于相比于基因组, 重复元件和高GC区比较 少, 使得拼接相对容易, 所以转录组研究在许多非模 式植物中得到了广泛应用。;(1)数字化信号:直接测定每个转录本片段序列, 单核苷酸分辨率的精确度, 可以检测单个碱基差 异、基因家族中相似基因以及可变剪接造成的不同 转录本的表达, 同时不存在传统微阵列杂交的荧 光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题, 能覆 盖信号超高的动态变化范围。(2

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