转录组分析(RNASeq).pptVIP

RNA-Seq 的技术背景 RNA-Seq又称转录组高通量测序（transcriptome sequencing）或称为全转录组鸟枪法测序（Whole Transcriptom Shotgun Sequencing WTSS） 原则上, 所有的高通量测序技术都能进行RNA测序。自2005年以来, 以Roche 公司的454 技术、Illumina 公司的Solexa 技术和ABI 公司的SOLiD 技术为标志的新一代测序技术相继诞生, 之后HelicosBiosciences 公司又推出单分子测序(Single molecule sequencing, SMS)技术。新一代测序又称作深度测序或高通量测序, 是相对于传统的Sanger 测序而言,主要特点是测序通量高, 测序时间和成本显著下降。各平台测序原理及序列长度的差异决定了各种高通量测序仪具有不同的应用侧重 RNA-Seq 原理 把高通量测序技术应用到由mRNA 逆转录生成的cDNA 上, 从而获得来自不同基因的mRNA 片段在特定样本中的含量, 这就是mRNA 测序或 mRNA-Seq, 同样原理, 各种类型的转录本都可以用深度测序技术进行高通量检测, 统称作RNA-Seq RNA-Seq 的应用领域 RNA-Seq 面临的挑战 庞大的数据量所带来的信息学难题 如何针对更复杂的转录组来识别和追踪所有基因中罕见RNA 亚