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- 2017-05-11 发布于湖北
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【图解】一次性下载已知线粒体基因组中13个蛋白质编码基
【图解】一次性下载已知线粒体基因组中13 个蛋白质编码基因序列
熊荣川
在系统发育的相关研究中,常常会使用线粒体基因组序列。使用其中13 个蛋白质编码基因
构建系统发育树几乎已经成为线粒体基因组研究的惯用手段。那么在已经公布的线粒体基因
组中如何又快又准确的下载到13 个蛋白质编码基因呢?下面是图解详细的操作步骤:
首先打开
首先打开NCBI 首页(/)
然后在search 下来菜单中选择“Nucleotide ”,并在其搜索栏中输入序列号“AP011544 ”。进
入结果页面
在结果页面的左上角有“send ”链接,点击之后,选择“coding sequences ”
在文件格式中选择“FASTA Nucleotide”,则下载的是核苷酸序列
如果选择 “FASTA Protein”,则下载的是氨基酸序列
一般都保存为文本格式,使用记事本打开之后另存为fasta 格式即可。另外,保存的文件,
每条序列的名字太长,使用相关软件(如mega4.0)打开时,序列存在一定的问题,很多名
字部分的字母都被读成了序列去了,需要在文本状态下对相应的序列名称做适当的修改,这
个可以根据研究的需要,再次不作赘述。
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