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从DNA到RNA的过程
积累经验 利用经验 A. 不依赖于ρ因子的终止 此类终止反应中,无任何其它因子参与。 模板中存在终止转录的特殊信号——终止子,又称内在终止子(intrinsic termation) 每个基因或操纵子都有一个启动子和一个终止子。 内在终止子的特点: 终止位点上游一般存在一段富含GC碱基的二重对称区,其转录生成的mRNA容易互补形成的发卡式结构。 终止位点上游一般有4~8个A组成的序列,转录生成的mRNA的3′末端中相应的有一连串U序列。 新生RNA中出现发卡结构可导致RNA聚合酶暂停,破坏RNA-DNA杂合链5’端正常结构,寡聚U是杂合链3’端部分出现不稳定rU·dA区域。新生RNA链将解离出来。 终止效率与二重对称序列和寡聚U的长短有关。 B.依赖于ρ因子的终止 有些终止点的DNA序列缺乏共性,不能诱导转录的自发终止,需要ρ因子的参与。 “穷追”模型 大肠杆菌ρ-依赖型终止子占所有终止子的一半左右。 由于不同生理要求,转录过程中有时即使遇到终止信号,仍需要继续转录的现象。 C、抗终止 两种类型: 破坏终止位点RNA的茎-环结构 当介质中某一氨基酸的浓度较低时,缺乏相应氨酰-tRNA,将致使核糖体滞留在串联密码子上,mRNA不能形成特定的二级结构,末端茎-环结构被破坏,因此转录仍将继续进行,出现抗终止现象。 依赖于蛋白质因子的转录抗终止 蛋白复合物形成后,将会改变聚合酶的构象, 使之对终止信号不敏感,从而抗终止。 六、mRNA的加工 hnRNA 和 snRNA 核不均一RNA (heterogeneous nuclear? RNA, hnRNA):核内的初级mRNA snRNA (small nuclear RNA):核内小分子RNA 小分子核糖核酸蛋白体(small nuclear ribonucleoprotein,snRNP):也称并接体 (splicesome),由snRNA和核内蛋白质组 成,作为RNA剪接的场所。 断裂基因(splite gene):真核生物结构基因, 由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又 连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可 翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这 些基因称为断裂基因。 外显子(exon)和内含子(intron) 外显子:在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。 内含子:隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。 真核生物的结构基因中具有可表达活性的外显子,也含有无表达活性的内含子 转录产生的RNA要经过剪接、编辑、再编码及化学修饰等加工过程才能变成有活性的RNA分子。 转录作用产生出的 mRNA、tRNA及rRNA的初级转录本全是前体RNA或核不均一RNA(hn RNA),而不是成熟的RNA,它们没有生物学活性,还要在酶的作用下,进行加工才能变为成熟的、有活性的RNA。 RNA的加工过程主要是在细胞核内进行,也有少数反应是在胞质中进行。 A. RNA中的内含子 真核生物的基因往往是断裂的基因,其转录所形成的RNA前体要经过剪切,将内含子切除后,将外显子拼接起来才能形成成熟的mRNA。 真核基因平均含8~10个内含子,前体分子一般比成熟mRNA大4~10倍。 内含子两端边界存在共有序列:(GU-AG法则) 在内含子内部部分序列也可能参与内含子的剪接,他们可能是pre-mRNA剪接过程中各种核糖核蛋白剪接调节因子的结合位点。 B. mRNA的剪接 许多相对分子质 量较小的核内RNA (如U1,U2,U3, U4,U5和U6)以及 与这些RNA相结合 的核蛋白参与RNA 的剪接。 生物体内各种内含子: 与mRNA前体中主要(GU-AG类)和次要(AU-AC类)内含子剪接方式不同,I、II类内含子能进行自我剪接。 内含子类型 细胞内定位 GU-AG 细胞核,pre-mRNA(真核) AU-AC 细胞核,pre-mRNA(真核) I类内含子 细胞核,pre-mRNA(真核),细胞器RNA,少数细菌RNA II类内含子 细胞器RNA,部分细菌RNA III类内含子 细胞器RNA 双内含子 细胞器RNA Pre-tRNA内含子 细胞核,pre-tRNA(真核) I类内含子的自我剪接过程 Flash 12-22 II类内含子的自我剪接过程 酵母线粒体某些mRNA或rRNA前体中的内含子中一个腺苷酸上的2’-OH,进攻内含子的5’剪接点并生成2’,5’-磷酸二酯键,形成一个与3’外显子尚未脱离的“套索”式中间产物,同时5’外显子被剪下。 脱落的5’外显子中的3’-OH攻击内含子
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