4章蛋白质的共价结构–教学用.ppt

Insoluble polystyrene bead Attachment of carboxyl-terminal amino acid to reactive group on resin. Protecting group is removed by flushing with solution containing a mild organic base. ②去保护基 ①连接 * 蛋白质是生物功能的主要载体： 蛋白质的共价结构 第 4 章 一、蛋白质的分子大小 二、蛋白质结构的组织层次 三、肽 四、蛋白质测序的策略 五、蛋白质测序的一些常用方法 六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基 七、蛋白质一级结构的举例 八、蛋白质序列数据库 九、肽与蛋白质的化学合成：固相肽的合成 教学内容 一、蛋白质分子的大小 蛋白质Mr的范围： 6 000 ~ 1×106，下限一般认为从胰岛素（Mr 5 733）。 肽、蛋白质的一般区别： 一般情况，少于 50 个 氨基酸残基的低分子量 氨基酸多聚物为肽，寡肽或生物活性肽，有时也罕称多肽；多于50个氨基酸残基的称为蛋白质。有时把含有一条肽链的蛋白质不严谨地称为多肽。 多肽一词着重于结构，而蛋白质原则强调了其功能。 一、蛋白质分子的大小 单体蛋白、寡聚蛋白或多聚蛋白、亚基超分子复合体 对简单蛋白质，用 110 除它的 Mr 即可约略估计其氨基酸残基的数目。 蛋白质中 20 种基本 aa 平均 Mr 约 138，但多数蛋白质较小氨基酸占优势，平均 Mr 接近 128。形成一个肽键将除去一分子H2O)，所以氨基酸残基的平均 Mr 约为110 一、蛋白质分子的大小 氨基酸残基数目的估算 一、蛋白质的分子大小 二、蛋白质结构的组织层次 三、肽 四、蛋白质测序的策略 五、蛋白质测序的一些常用方法 六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基 七、蛋白质一级结构的举例 八、蛋白质序列数据库 九、肽与蛋白质的化学合成：固相肽的合成 教学内容 二、蛋白质结构的组织层次 一级结构：多肽链的氨基酸序列，包括共价键。 二级结构：多肽链借助氢键形成的有规则的局部结构，如α螺旋、β折叠等元件。 三级结构：借助次级键形成特定走向的球状实体. 四级结构：亚基借助非共价键彼此缔合成寡聚或多聚蛋白质. 一、蛋白质的分子大小 二、蛋白质结构的组织层次 三、肽 四、蛋白质测序的策略 五、蛋白质测序的一些常用方法 六、根据基因的核苷酸序列推定多肽的氨基 七、蛋白质一级结构的举例 八、蛋白质序列数据库 九、肽与蛋白质的化学合成：固相肽的合成 教学内容 (一) 肽和肽键的结构 (二) 肽的物理和化学性质 (三) 天然存在的活性肽 三、肽 肽：是由一个氨基酸的羧基和另一个氨基酸的氨基脱水缩合而成的化合物. 肽键：氨基酸间脱水后形成的共价键称肽键(酰氨键), 氨基酸→氨基酸残基. 二肽：两个氨基酸，寡肽:2-10个氨基酸，多肽多于10个氨基酸. （一）肽键的结构 （一）肽键的结构 氨基末端(残基) 羧基末端(残基) 酰胺基称为肽基或肽单位 多肽链主链：肽链骨架由-N-Cα-C-重复排列而成 （一）肽键的结构 酰胺氮上的孤对电子与羰基O之间的共振作用, 形成共振杂化体, 稳定性高. 肽键具部分双键性质，不能自由旋转, 具平面性.６个原子几乎处在同一平面内(酰氨平面)。Ｃ－Ｎ有的40%的双键性质，C＝O 有40%的单键性质。 肽键亚氨基在pH0~14内不解离. 肽键一般是反式构型，而Pro肽键可能出现顺、反两种构型． 肽键的结构特点： 短肽以偶极离子形式存在。pH 0―14，亚氨基不解离，酸碱性取决于Ｎ端α-NH3+和Ｃ端α-COO-以及侧链Ｒ上可解离的基团。 α-羧基，α-氨基和侧链R基上的活性基团都能发生与游离氨基酸相似的反应。 凡有肽键结构的化合物都会发生双缩脲反应，可用于定量分析。双缩脲反应是肽和蛋白质特有的反应。 旋光性: 一般短肽的旋光度等于其各个氨基酸的旋光度的总和; 蛋白质水解得到的各种短肽, 只要不发生消旋作用, 也具有旋光性. （二）肽的物理和化学性质 先分别判断各解离基团带电情况, 再统计净电荷的量 （二）肽的物理和化学性质 ＞12 胍基 7.8 α-NH3+ 10.2 ε-NH3+ 7.0 咪唑基(His) 9.6 酚-OH 4.6 侧链-COOH 8.8 -SH 3.7 α-COOH 推测的PKa值 可解离功能基团 推测的PKa值 可解离功能基团 肽 pI 的计算: 从模型化合物获得数据推测的多肽连可解离基团的pKa值 pI = 1/2(4.5+7.8) = 6.15 （三）天然存在的活性肽(自学) -2 -NH2 -NH2 -COO- -COO- ﹥10.2 -1 -NH3+ -NH2 -CO