基因组时代放线菌系统学及其研究进展.pdfVIP

Special Section 专论 微生物学报 A cta M icrobiolog ica Sinica 5 1 (2 ):14 1 － 153 ;4 February 20 11 ISSN 000 1 － 6209 ;CN 11 － 1995 / Q http :/ / journals. im . ac . cn / actamicrocn 基因组时代的放线菌系统学及其研究进展 1 1 ，2 1 ，2 * ， ， 刘志恒 王剑 张立新 1 ， 100 190 中国科学院微生物研究所 北京 2 ， 5 1030 1 中国科学院南海海洋研究所 广州 : 、 ， 摘要 由于放线菌在生物技术 医药卫生和环境治理等领域中的实际重要性 已经成为人们研究得最为深入 。 16 S rRNA 的微生物类群之一 现代放线菌分类学是建立在对 基因保守分子序列的系统发育学分析基础 、 (polyphasic taxonomy )。 ， 上 综合利用多种微生物信息的多相分类学 随着大规模基因测序技术的飞速发展 100 。 “ ” 已经完成了超过 株放线菌的全基因组序列 近年来发展起来的 基因组系统发育学 有助让人们更加 、 ， 。 系统地理解放线菌类群的发生 演化 以及不同生境类群之间的相互关系 随着越来越多的以系统发育学为 ， “ (Genomic Encyclopedia of Bacteria and 指导的基因组测序研究项目 例如 细菌和古菌基因组百科全书 Archaea ，GEBA ) ” ， 。 计划 的出现 标志着放线菌系统学进入了基因组学研究时代 本文对基因组时代的放线 ， 。 菌系统学方法 以及国内外的相关研究成果进行综述 : ， ， ，GEBA 关键词 放线细菌 放线菌分类学 基因组系统发育学 计划 中图分类号:Q939. 13 文献标识码:A 文章编号:000 1-6209 (20 11)02 -0 14 1-13 17 ， Antoni van Leeuwenhook 生物中最为重要的类群之一的放线菌， 自 世纪中叶 荷兰人 其系统分类 ， 用自己制造的的显微镜观察微生物以来 人们对微 体系的发展从一个侧面印证了系统学在基因组时代 生物的认识随着新技术的不断出现也越来越深入。 发生的深刻变化。 20 70 DNA 诞生于 世纪 年代的