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长非编码RNA–是指大于200nt的RNAs位于细胞核或胞浆内不参与或很少参与蛋白质的编码
长非编码RNA-是指大于200 nt的RNAs,位于细胞核或胞浆内,不参与或很少参与蛋白质的编码。
长非编码RNA-是指大于200?nt的RNAs,位于细胞核或胞浆内,不参与或很少参与蛋白质的编码。
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学术术语来源---
人脂肪干细胞脂向分化中长非编码RNA的差异表达
文章亮点:
脂肪干细胞传代至第3代后诱导其脂向分化,获取诱导过程中0,5,12?d总RNA。通过微阵列测序技术对不同诱导时期RNA进行高通量分析,筛选出差异倍数明显的长非编码RNA。结合生物信息学报告进一步筛选出可能在脂向分化过程中发挥重要作用的长非编码RNA并通过实时荧光定量PCR进行验证,为进一步实验提供依据。?
关键词:
干细胞;脂肪干细胞;脂向分化;长链非编码RNA差异性表达;lncRNAs;生物信息学报告;qRT-PCR
主题词:
腹内脂肪;间质干细胞;成脂分化;RNA
摘要
背景:肥胖导致了包括高血压、冠心病、脂肪肝、高脂血症、2型糖尿病在内的诸多疾病,因此深入理解脂肪细胞分化机制对于肥胖的防治具有深远意义。目前对于脂向分化机制的研究多集中在微小RNA上,对于长非编码RNA在脂向分化过程中的作用尚且知之甚少。
目的:获得脂向分化过程中差异倍数明显的长非编码RNA,并进一步筛选在脂向分化过程中可能发挥重要作用的长非编码RNA进行验证。
方法:取人腹部皮下脂肪,采用组织块培养法获取脂肪干细胞,传至第3代后进行成脂诱导分化,通过微阵列技术对脂向分化过程中0,5,12?d长非编码RNA及mRNA差异性表达量进行统计,并结合生物信息学报告筛选出呈现明显差异性表达的长非编码RNA,通过qRT-PCR进行验证。
结果与结论:脂向分化过程中以差异倍数1.5(P??0.05)为标准,上调长非编码RNA的数量5?d?vs.?0?d?748个,12?d?vs.?0?d?847个,12?d?vs.?5?d?593个;下调长非编码RNA的数量5?d?vs.0?d?828个,12?d?vs.0?d?1?113个,12?d?vs.5?d?750个;结合生物信息学分析结果,在与脂类代谢有关的28个长非编码RNA中根据诱导0,5,12?d差异表达倍数较高且其靶基因可能是已知的与成脂相关的基因中,筛选出3个长非编码RNA:AK304548、BP216319、DA852857。通过PCR验证结果显示AK304548、BP216319及其靶基因表达量呈现先下调后???调的趋势,与微阵列测序结果相符,预示其在脂向分化过程中起到调控作用。
HYPERLINK / 中国组织工程研究杂志出版内容重点: HYPERLINK / 干细胞;骨髓干细胞;造血 HYPERLINK / 干细胞;脂肪干细胞;肿瘤干细胞;胚胎干细胞;脐带脐血干细胞;干细胞诱导;干细胞分化; HYPERLINK / 组织工程
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