生物大分子提取技术.pptVIP

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3. 酚抽提纯化DNA: 冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。5000g离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复酚抽提一次。加等体积的氯仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,5000g离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复一次。 4. 沉淀DNA: 加入1/5体积的3mol/L NaAc及2倍体积的冷无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。用玻璃棒小心挑取云絮状的DNA,转入另一1.5 ml离心管中,加70%乙醇0.2ml,5000g离心5min洗涤DNA,弃上清。重复一次。室温挥发残留的乙醇,但不要让DNA完全干燥。加TE液适量溶解DNA ,DNA完全溶解通常需12-24小时。 5. DNA的浓度测定及纯度判定: 取DNA溶液用TE液做适量稀释,以TE液作空白对照,在紫外分光光度计上读取A260和A280的光密度值。 按下面公式计算浓度: DNA浓度(ug/ul)= A260*50*稀释倍数/1000 DNA纯度的判定: A260/A280 比值应介于1.7-1.8之间。 人基因组DNA RNA的提取纯化 意义: 完整RNA的提取和纯化,是进行RNA研究工作如Nothern杂交、mRNA分离、RT-PCR、定量PCR、cDNA合成及体外翻译等实验的前提。 关键点: 1)样品细胞或组织的有效破碎; 2)有效地使核蛋白复合体变性; 3)对内源RNA酶的有效抑制; 4)有效地将RNA从DNA和蛋白混合物中分离; 5)对于多糖含量高的样品还牵涉到多糖杂质的有效除去。 RNA的提取途径: 1)提取总核酸,再用氯化锂将RNA沉淀出来;该提取方法将导致小分子量RNA的丢失,目前已很少使用。 2)直接在酸性条件下用酚-氯仿抽提,异丙醇沉淀,再用乙醇洗涤沉淀,即可去除几乎所有残留的蛋白质和无机盐 。 因为酸性条件下DNA与蛋白质进入有机相而RNA留在水相。 举例:组织(细胞)总RNA提取 1 、 试剂耗材准备 RNA提取缓冲液:4M 异硫氰酸胍、25mM 柠檬酸钠 、100mM β-巯基乙醇; 饱和酚:氯仿:异戊醇(50:49:1); 3M 醋酸钠 pH5.2; DEPC处理的去离子水:0.5% DEPC的去离子水,充分摇匀,放置4小时以上,蒸汽高压灭菌,分装成小份; RNA酶抑制剂; 15ml、1.5ml等离心管,0.1%DEPC浸泡过夜,蒸汽高压灭菌 。 2 操作步骤 1)将10-30mg组织加入1ml RNA提取缓冲液,匀浆化;或将1ml RNA提取缓冲液加入1瓶培养细胞(10E6-10E7细胞),充分混匀,并使细胞裂解; 2)4℃/12000rpm离心10分钟,上清转移到另一干净的离心管; 3)加入等体积饱和酚:氯仿:异戊醇,混匀,冰浴10分钟; 4)4℃/12000rpm离心5分钟,小心转移水相; 5)氯仿:异戊醇抽提一次,转移水相; 6)加入1/10体积的3M 醋酸钠和2.5倍无水乙醇,混匀,冰浴1小时; 7)4℃/14000rpm离心10分钟; 8)弃上清,75%乙醇洗一次,真空干燥20分钟; 9)加入20-50ul DEPC处理水溶解RNA,可加入少量RNA抑制剂;或加入1ml 乙醇和 1/10体积3M 醋酸钠(pH5.2),-20℃--70℃保存 核酸的纯化 1、粗分级分离 从细胞中提取得到的核酸,常混杂有蛋白质及各种大小的核酸同类物等杂质,可采用适当方法进行粗提纯。 粗提纯中,进一步将蛋白质除去,可用去污剂或有机溶剂多次反复提取。 从RNA除去混杂的DNA,可用DNase将DNA降解掉。 从DNA中除去混杂的RNA,可用RNase将RNA降解掉。 2、精分级分离 核酸样品进行精提纯,一般常用超离心、电泳、柱层析等方法。 超离心包括速度区带离心、沉降平衡超离心。 电泳包括聚丙烯酰胺凝胶电泳、琼脂糖电泳。 前者凝胶孔径小,适合分离1000个核苷酸以下的核酸分子。后者孔径大,适合分离较大的核酸分子。 柱层析主要有凝胶过滤柱层析、离子交换层析、羟基磷灰石柱层析。 3、纯度鉴定: 核酸的纯度鉴定一般采用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶电泳,沉降分析和紫外吸收(A260/A280)等方法。 RNA的浓度测定及纯度判定:取RNA溶液用DEPC处理的纯水做适量稀释,以纯水作空白对照,在紫外分光光度计上读取A260和A280的光密度值。 按下面公式计算浓度: RNA浓度(ug/ul)= A260*40*稀释倍数/1000 RNA纯度的判定: A260/A280 比值应介于1.8-2.0之间。 一、蛋白质(酶)的分离纯化 蛋白质分离纯化的方法很多,主要是根据蛋白分子特异

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