转录组测序结题报告.pdfVIP

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  • 2017-05-23 发布于河南
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转录组测序结题报告

转录组测序结题报告 1.mRNA 纯化: 抽提得到的总RNA 首先利用10U 的 DNaseI (Ambion ,美国)在37℃消 化1 小时;然后利用Micropoly(A)PuristTM mRNA purification kit (Ambion ,美 国),进行mRNA 纯化:把RNA 稀释到250μl的体积,按照Kit 的操作步骤(Cat.No: 1919)进行;最后得到的mRNA 用100μl预热的THE 缓冲液洗脱,利用NanoDrop 进行定量。 2 .cDNA 合成: cDNA 合成是在Ng 等2005 年发表的方法基础上改进而成(文献1,图1)。 第一链cDNA 合成利用GsuI-oligo dT 作为反转录引物,10μg的mRNA 作为模板, 用1000 单位的Superscript II reverse transcriptase (Invitrogen,美国)在42℃作用1 小时 完成;随后利用NaIO4 (Sigma,美国)氧化mRNA 的5’帽子结构,并连接生物素;通 过Dynal M280 磁珠(Invitrogen,美国)筛选连接了生物素的mRNA/cDNA ,并通过碱 裂解释放第一链cDNA;然后通过DNA ligase

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