植物乳杆菌编码复制起始蛋白天然质粒的系统进化分析.PDFVIP

微生物学通报 May 20, 2017, 44(5): 1047−1055 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160940 研究报告 植物乳杆菌编码复制起始蛋白天然质粒的系统进化分析 * 孙大庆 李洪飞 杨健 ( 163319) 摘 要：【目的】探究复制起始蛋白(Replication initiation protein ，Rep)是否可以作为天然质粒 系统进化关系研究的分子标记。【方法】以植物乳杆菌天然质粒编码的Rep 为研究对象，通过 构建Rep 系统进化树详细分析和讨论这些质粒的系统进化关系。【结果】植物乳杆菌45 个编码 Rep 天然质粒可以划分为5 个进化关系紧密的家族和 1 个独立进化质粒pG6302 ，家族1−4 质 粒可以进一步划分为 10 个进化关系更近的亚家族类群，因此这些质粒可能起源于6 个祖先质 粒。【结论】Rep 氨基酸序列显示了适度的保守性和变异性，是植物乳杆菌编码Rep 质粒进化 研究理想的分子标记，为植物乳杆菌天然质粒系统进化研究提供了一种简单、有效的分析方 法和标准，并为植物乳杆菌或其他乳酸菌天然质粒系统进化研究提供了分子水平的佐证和 依据。 关键词：植物乳杆菌，质粒，系统进化树，复制起始蛋白 Phylogenetic analysis of natural plasmids encoding the replication initiation protein in Lactobacillus plantarum * SUN Da-Qing LI Hong-Fei YANG Jian (National Coarse Cereals Engineering Research Center, Heilongjiang Bayi Agricultural University, Daqing, Heilongjiang 163319, China) Abstract: [Objective] In order to explore whether replication initiation protein (Rep) can be used as a molecular biomarker for the phylogenetic relationship study of natural plasmids. [Methods] The Reps of natural plasmids of Lactobacillus plantarum as a target, the phylogenetic relationships of these plasmids were analyzed and discussed in detail by constructing Rep phylogenetic tree. [Results] A total of 45 plasmids encoding Rep in Lactobacillus plantarum could be clustered into 5 closely related families and 1 single plasm