浅谈系统发育分析及进化树制作.pptVIP

B. 每组取样重建进化树. 12345 100 1 : AATTT…T 2 : AATTT…G 3 : AACTT…T 4 : AACTT…T 11244 x 12345 100 1 : TTTAT…T 2 : TAACC…G 3 : TAACC…T 4 : TGGGA…T 4 7789…x 12345 100 1 : AGGTA…T 2 : AGGAC…G 3 : AAAAC…A 4 : AAAGG…C 15578… x Sp1 Sp2 Sp3 Sp4 Sp1 Sp2 Sp3 Sp4 Sp1 Sp2 Sp3 Sp4 Bootstrap－自展法 * C. 计算各分支出现的可信度 Sp1 Sp2 Sp3 Sp4 Sp1 Sp2 Sp3 Sp4 Sp1 Sp2 Sp3 Sp4 Sp1 Sp2 Sp3 Sp4 67% 100% In 67% of the data sets, the split between SP1+SP2 and the rest of the tree was found. Bootstrap－自展法 * 得到CA16 VP1序列，利用MEGA软件进行处理和分析序列： 1）用MEGA软件对多序列进行比对，建立MEGA软件构建进化树的数据格式（两端对齐，fasta格式输出）； 2）用N-J法构建基因进化树； 3）对所