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A replication eye forms a theta structure in circular DNA. 线粒体DNA的D-噜噗复制 双链环状DNA中的一条前导链已经引发并开始合成，与其模板形成双链结构，而另一条亲本链则被前导链置换出来成为单链状态。这种由一条单链和一条双链组成的三元泡状结构，叫做置换噜噗或D-噜噗（displacement loop）。只有前导链将另一条亲本链（即滞后链的模板）的特别序列置换出来成为单链形式，才能产生滞后链前体的引发并合成其互补链。线粒体DNA的复制（图5-16）就是以这种有趣的不对称方式进行复制，并由真核DNA聚合酶γ负责。 滚环复制是单向复制的特殊方式，是某些噬菌体DNA复制的共同方式，E.coli噬菌体（如φX174、M13）的环形双螺旋DNA复制时，仅仅以1条链作为模板合成若干环形DNA分子拷贝；此外，实验证明，某些双链DNA的合成也可以通过滚动环的复制方式进行，例如，噬菌体λ复制的后期以及真核生物如非洲爪蟾卵母细胞中rDNA基因的扩增都是以这种方式进行的。 在滚环复制中，有一种情形是在3-端不断延长时，5-端不断地甩出，好像中间的一个环在不断地滚动一样，因此得名为滚环复制。又由于其形状像希腊字母σ，因此又称作σ滚环复制 DNA连接酶在复制、DNA修复、 重组、剪接中均起缝合缺口作用。 是重要的工具酶之一。 解旋解链酶类 　　解开并理顺DNA双链，维持DNA 处于单链状态。主要有解螺旋酶、 DNA拓扑异构酶和单链DNA结合蛋白。 解螺旋酶 (helicase) : 　模板对复制的指导作用在于碱基的准确 配对，而碱基却埋在双螺旋的内部。只有把DNA解开成单链，它才能起模板作用。 解螺旋酶是最早发现的与复制有关的蛋 白质，当时称为rep蛋白。作用是利用ATP供 能，解开DNA双链。 复制相关蛋白的基因：dna A、dna B、dna C… …dna X 　　相应的表达产物蛋白质：Dna A、Dna B、Dna C … …Dna X 　　 Dna A：辨认复制起始位点 　　 Dna B：解螺旋酶 　　 Dna C：辅助解螺旋酶使其在起始点上 结合并打开双链。 单链DNA结合蛋白 (SSB) 　　SSB曾被称为螺旋反稳定蛋白（HDP）。在大肠杆菌，它是由177个氨基酸残基组成的 同四聚体，结合单链DNA的跨度约32个核苷 酸单位。 　　SSB与解开的DNA单链紧密结合，防止 重新形成双链，并免受核酸酶降解。在复制 中维持模板处于单链状态。 DNA拓扑异构酶 (topoisomerase) : 拓扑：是指物体或图像作弹性移位而又保 持物体不变的性质。 拓扑异构酶：是一类可改变DNA拓扑性质 的酶。对DNA分子的作用是既能水解、又 能连接磷酸二酯键。可松弛DNA超螺旋， 有利于DNA解链。 拓扑异构酶I（topo I）: 在原核生物曾被称为?－蛋白。 主要作用是切开DNA双链中的一股，使 DNA解链旋转中不打结，DNA变为松弛 状态再封闭切口。 拓扑异构酶II（ topo II）: 在原核生物又叫旋转酶(gyrase)。 能切断DNA双链，使螺旋松弛。在ATP参 与下，松弛的DNA进入负超螺旋，再连接 断端。 引物酶和引发体 引物酶 (primase): 依赖DNA的RNA聚合酶。 催化RNA引物的合成。 在大肠杆菌，引物酶是dna G基因的产物。 RNA引物： 　　在DNA模板的复制起始部位由引物酶催 化NTP的聚合，形成短片段的RNA，为DNA 聚合提供3′-OH末端。 引发体 (primosome): 是由Dna B、Dna A、Dna C以及其他复制 因子一起形成复合体，再结合引物酶形成 较大的聚合体，结合到模板DNA上。 复制开始时，在引发体的下游解开双链， 再由引物酶催化引物的合成 DNA的复制过程：（以大肠杆菌为例） 复制的起始 1、起始复合物的形成：称为引发 2、RNA引物的合成 链的延伸： 复制的终止： 复制原点oriC和原点的识别： DNA的复制有特定的起始位点，叫做复制原点。常用ori C(或o）表示。大肠杆菌的复制原点ori C由245个bp构成，含两组保守的重复序列：三个13bp的序列（富含A、T的序列）和四个9bp的序列；许多生物的复制原点也都是富含A、T的区段。 复制原点由DnaA蛋白识别， 在原点由DnaB蛋白（解螺旋酶）将双螺旋解开成单链状态，分别作为模板，合成其互补链(DNA双链的解开还需DNA拓扑异构酶Π 、 SSB),在原点处