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病毒RNA提取手册
法则:QIAamp病毒RNA试剂盒在扩增技术中提供最快捷和简便的方式来纯化病毒RNA,纯化病毒RNA可以使用非肝素抗凝的血浆,血清和其他无细胞体液。样本可以新鲜或冻融不超过一次(多次冻融可导致病毒载量下降并应该避免该种情况)。样本反复冻融会有冷沉淀物的聚集,当使用真空管时会导致QIAamp滤膜的堵塞。 QIAamp病毒RNA试剂盒一般可用于从许多病毒中分离出单个病毒RNA,但不能保证每种病毒均适用。程序:QIAamp病毒RNA试剂将硅胶膜的选择结合特性和微旋转或真空技术的速度连接起来,理想地适用于多样本的同时处理。样本首先溶解于高浓度变性液,来确保RNA酶失活并且完整的病毒RNA分离。然后调整缓冲液来提供RNA与膜结合的最适条件,如此样本装载到旋转柱中。RNA结合在膜上,污染物通过使用两种不同的清洗液,两步实现特异性洗脱。高质量RNA通过特异性无RNA酶的缓冲液洗脱下来,可直接使用或安全储存起来。洗涤过的RNA不含蛋白,核酸酶和其他污染物或抑制剂。特异性的QIAamp膜能确保在20分钟内高度回收纯净而完整的RNA,不需要使用苯酚或氯仿萃取,也不需要酒精沉淀。所有的缓冲液或试剂都不含RNA酶。重点:第一次准备RNA请参考附录 该试剂盒所有步骤均应在室温下快速完成。 收集并离心样本后,血浆或血清可存放于2-8℃中6小时,长期储存应在-20至-80℃冻融别超过一次。反复冻融可导致蛋白的失活和凝集,使病毒滴度降低并随后导致病毒RNA产量的降低。另外,冻融形成的冷凝集可堵塞滤膜,如果冷凝集可见,可简单通过6800g离心3分钟来浓缩分离,离心后在不搅动片状沉淀物同时移走上清液。 避免细胞中DNA的干扰:1.推荐使用无细胞体液 2.对含有细胞的样本(包括脑脊液、骨髓、尿液和试子),首先应过滤或者是1500g离心十分钟,留取上清液 3.若RNA和DNA已经并联分离,洗出液可通过不含RNA酶的DNA酶来消化处理,随后高温处理(70℃15分钟)来使DNA酶失活 该试剂盒能分离超过200个碱基的RNA分子,小的RNA分子在该条件下无法定量。手册:纯化病毒RNA(spin) 开始前准备工作:室温平衡样本 室温平衡AVE缓冲液 检查AW1和AW2两种缓冲液是否准备妥当 添加carrierRNA—AVE缓冲液到AVL缓冲液 附表:试剂准备 1.添加310ul AVE缓冲液到包含310ug冷冻干燥的carrierRNA的管中,形成 1ug/ ul 的溶液。彻底溶解carrierRNA,分成适宜等分,-20℃保存。冻融次数不要超过3次。 检查AVL中的沉淀,如有必要80℃孵育到沉淀溶解。计算需要的缓冲体系的体积。操作步骤:Carrier RNA 加入310ul AVEAW1:加入125ml无水乙醇AW2:加入160ml无水乙醇按说明书比例配 AVL+( Carrier RNA-- AVE )560ul (AVL+ Carrier RNA-- AVE )+140ul 血浆样品于EP管中,震荡15s室温孵育10分钟,充分裂解加入560ul无水乙醇,震荡15s取630ul 上述液体注入带有滤柱的管内放入离心机离心,6000g,一分钟弃掉套管内液体,再将剩余630ul 注入离心,6000g,一分钟弃掉套管换新套管,柱内加入500ul AW1离心,6000g,一分钟弃掉套管换新套管,柱内加入500ul AW220000g,离心三分钟弃掉套管换EP管, 6000g,一分钟空离换EP管柱内隐膜上方加入60ul AVE,需加入滤柱中间,孵育5分钟6000g,离心一分钟,RNA样品于-70℃保存
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