生物化学(第一篇)2.ppt

第一章　蛋白质化学;;第一节 蛋白质（protein）及其生物学功能 ;生物信息大分子具有如下特征：;;2、蛋白质的重要生物学功能;第二节 蛋白质的分子组成;一、元素组成;二、结构单位——氨基酸（amino acid）;D-氨基酸：抗生素，生物碱;;;;;;;Tyr;;;;;非蛋白质氨基酸;蛋白质基本结构单位：L－?－氨基酸 ?－氨基酸：脯氨酸（亚氨基酸）除外 L－氨基酸：甘氨酸（无不对称C）除外 氨基酸结构通式：RCH(NH2)COOH 常见氨基酸种类：20种。;2、氨基酸分类：按其侧链R的结构和理化性质分类; ③酸性氨基酸（含有两个羧基）： Glu（含γ羧基）、Asp（含β羧基） ④碱性氨基酸（含有两个以上氨基）： Arg（胍基）、His（咪唑基）、Lys（ε氨基）;三、氨基酸的理化性质;甘氨酸的酸碱滴定曲线;(zwitterion);等电点计算 ①侧链为非极性基团或虽为极性基团但不解离的氨基酸：pI=?(pK1+pK2) ②酸性氨基酸(Glu、Asp)及Cys：pI=?(pK1+pKR) ③碱性氨基酸(赖、精、组)：pI=?(pK2+pKR);等电点的计算;3、紫外吸收：;;氨基酸的化学反应;氨基酸的化学反应;氨基酸的化学反应;氨基酸的化学反应;氨基酸的化学反应;Edman （苯异硫氰酸酯法）氨基酸顺序分析法实际上也是一种N-端分析法。此法的特点是能够不断重复循环，将肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。 肽链（N端氨基酸）与PITC偶联，生成PTC-肽 环化断裂：最靠近PTC基的肽键断裂，生成PTC-氨基酸和少 一残基的肽链，同时PTC-氨基酸环化生成PTH-氨基酸 分离PTH-氨基酸 层析法鉴定 Edman降解法的改进方法 DNS-Edman降解法 用DNS(二甲基萘磺酰氯)测定N端氨基酸 原理DNFB法相同 但水解后的DNS-氨基酸不需分离，可直接用电泳或层析法鉴定 由于DNS有强烈荧光，灵敏度比DNFB法高100倍，比Edman法高几到十几倍 可用于微量氨基酸的定量;;氨基酸的化学反应;氨基酸的化学反应;显色反应： 茚三酮反应:氨基羧基同时参加反应;显色反应： 茚三酮反应;成肽反应：;;第三节 氨基酸的分离纯化;一、层析技术的原理;;;利用化合物在两种互不相溶（或微溶）的溶剂中溶解度或分配系数的不同，使化合物从一种溶剂内转移到另外一种溶剂中。经过反复多次萃取，将绝大部分的化合物提取出来。 ;A、B两个溶液系统、 I（A:B=2:1） 1g II（A:B=1:3） 1g 第一次萃取后 A中I有2/3g, II有1/4g I:II=8:3 （2.6倍） B中I有1/3g, II有3/4g I:II=4:9 （2.15倍） 第二次萃取后 A中I有4/9g, II有1/16g I:II=64:9 （7.1倍） B中I有1/9g, II有9/16g I:II=16:81（5.1倍）;;;;;;;;HPLC:根据出峰的位置及峰高或峰面积，可以定性及定量。层析法与光学、电学或电化学仪器连用，可使操作及数据处理自动化，大大缩短分析时间。由于层析法具有分辨率高、灵敏度高、速度快等特点，因此适用于杂质多、含量少的复杂样品分析，尤其适用于生物样品的分离分析。近年来，已成为生物化学及分子生物学常用的分析方法。在医药卫生、环境化学、高分子材料、石油化工等方面也得到了广泛的应用。;二、电泳法(electrophoresis);;;;;三、氨基酸的显色反应;第四节 蛋白质的分子结构;概念;一、蛋白质分类;一、蛋白质分类;一、蛋白质分类;二、蛋白质结构中的化学键;二、蛋白质结构中的化学键;二、蛋白质结构中的化学键;二、蛋白质结构中的化学键;次级键介导蛋白质高级结构形成;（一）、蛋白质的基本结构形式;特点： 肽键的特点是氮原子上的孤对电子与羰基具有明显的共轭作用。 肽键中的C-N键具有部分双键性质，不能自由旋转。 组成肽键的原子处于同一平面。 在大多数情况下，以反式结构存在。;;;;2、肽分类、命名;在多肽链中，氨基酸残基按一定的顺序排列，这种排列顺序称为氨基酸顺序 通常在多肽链的一端含有一个游离的α-氨基，称为氨基端或N-端；在另一端含有一个游离的α-羧基，称为羧基端或C-端。 氨基酸的顺序是从N-端的氨基酸残基开始，以α-端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为： Ser-Val-Tyr-Asp-Gln;3、生物活性肽： 谷胱甘肽 神经肽：脑啡肽(5)、内啡肽(31-16)、强啡肽(17,9)、P物质、Y肽 肽类激素：催产素、胰高血糖素、促肾上腺皮质激素、加压素等 其他：生长因子；短杆菌肽；青霉素等;;;;;二、蛋白