组成新发典型甲型H1N1流感病毒8个基因片段的变异性分析与疫病流行原因初探.pdfVIP

中国兽医科学 　2009 ,39 (08) :679684 Chinese Vet erinary Science 中图分类号 : S 852 . 659 . 5 　文献标志码 : A 　文章编号 : (2009) 组成新发典型甲型 H1 N1 流感病毒 8 个基因片段的 变异性分析与疫病流行原因初探 1 1 1 2 2 1 姚 　碧 ,陈海龙 ,刘 　琨 ,张乐之 ,赵玉军 ,马兴元 ( 1. 华东理工大学 生物反应器国家重点实验室 ,上海 　200237 ; 2 . 沈阳农业大学 畜牧兽医学院 ,辽宁 沈阳　110 16 1) 　　摘要 : 为探索新近暴发的甲型 H 1N 1 流感病毒各基因片段的变异性与本次疫病流行的内在原因 , 以 N CB I GenBank 中报道的 1 株新发的典型 H 1N 1 甲型流感病毒 A/ N ew Yor k/ 1669/ 2009 ( H 1N 1) 作为研究 对象 ,运用在线BL A ST 和 CL U STAL X 等生物信息学软件对其 PA 、N P 、M 、PB 1 、PB2 、N A 、HA 和 N S 基因 片段进行了比较分析 。结果表明 ,新发甲型 H 1N 1 流感毒株的 PB 1 、N P 基因来源于人源谱系流感病毒 , HA 、N A 、N S 、M 基因来源于猪源谱系流感病毒 ,PB2 和 PA 基因来源于禽源谱系流感病毒 。此外 ,新发甲型 H 1N 1 流感病毒的 HA 和 N A 分别在第 249 和 386 位新出现 1 个“N T T”、“N F SI”的糖基化位点 。HA 的 6 个潜在抗原决定簇中有 3 个发生了氨基酸序列改变 ,N A 则是 12 个中有 5 个发生了改变 。表明 ,这些抗原 基因的大范围重组与高频率变异可能是造成这次流感暴发与大规模流行的根本原因。 关键词 : 甲型 H 1N 1 流感病毒 ;基因片段 ;变异性 ;流行原因 Analyses of variabil ity of eight gene fragments of influenza A( H1 N1) virus A/ Ne w York/ 1669/ 2009( H1 N1) and its pandemicity YA O Bi1 ,C H EN Hailong1 ,L IU Kun1 ,ZHAN G L ezhi2 ,ZHA O Yuj un2 ,MA Xin gyuan1 ( 1. S t ate Key L aboratory of B ioreactor Eng i nee ri ng/ E as t Chi na Uni ve rs i ty of S cience an d Technology , S hang hai 200237 , Chi na; 2 . Col leg e of A ni m al H usban d ry an d Vete ri na ry M e d ici ne , S heny ang A g ricul t u ral ) Uni vers i ty , S heny ang 110 16 1 , Chi na 　　Abstract : In or der to exp lore t he int er nu s rea son s of t he recent p andemic influenza and t he variabilit y of eight gene f ragment s of influenza A ( H