实验四重组质粒的抽提.docVIP

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实验四重组质粒的抽提

实验四 重组质粒的抽提 实验目的 了解基因工程操作中运载基因的载体,掌握最常用的提取质粒DNA的方法。 实验原理 碱变性抽提质粒DNA是根据质粒DNA与染色体DNA的变性与复性差异而达到分离的目的。利用溶菌酶、强碱(NaOH)及表面活性剂(SDS)使细胞破壁、膜,释放出胞内染色体DNA、质粒DNA及其它物质。通过一系列的纯化过程:高盐除去核DNA,苯酚-氯仿抽提变性蛋白和脂类,然后用乙醇(或异丙醇)沉淀出质粒DNA和RNA等,RNA经RNase消化,得到质粒DNA。这种质粒DNA可用作基因工程的载体,更广泛地用于重组子的鉴定。 实验材料 E.coli 实验仪器、器皿及试剂 仪器、器皿(略) 试剂: 1、溶液1:50mmol/l 葡萄糖 10mmol/l EDTA-Na2 25mmol/l Tris-HCl(pH8.0) 4mmol/l 溶菌酶 2、溶液2:200mmol/l NaOH 1% SDS 3、溶液3:5mol/lKAc 60ml 冰乙酸 11.5ml ddH2O 28.5ml 4、苯酚-氯仿 5、异丙醇(或95%乙醇,100%乙醇) 6、70%乙醇 7、TE(pH8.0):10mmol/l Tris-HCl(pH8.0) 1mM EDTA-Na2 8、RNase 1mg/ml Amp 100μg/ml 实验步骤 1.挑取一单菌落的E.coli菌种接种到含Amp100μg/ml的LB液体培养基中,37℃震荡培养过夜。 2.吸1.4ml菌液至Eppendorf管中,在高速台式离心机上5000g离心2min,倒去培养基。 3.重复1次,尽可能倒出培养基并将Eppendorf管倒置于吸水纸上,以吸干管壁上残留的培养基,收集细菌。 4.将细菌悬于500μl冰冷的溶液1中,于离心机上5000g离心2min。 5.倒去溶液1,再悬于200μl冰冷的溶液1中,重悬菌液。 6.加入300μl新配制的溶液2,冰浴5min。 7.加入300μl冰冷的溶液3,中和,轻轻震荡10sec,置冰浴5min。 8.于离心机上,12000g离心5min。 9.取600μl上清转移至一新管中。 10.加入等体积的饱和酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提1次,10000g离心5min取上清液,转移至一新管。 11.加入1/10体积NaAc溶液(3mol/l),再加入2倍体积的无水乙醇 ,-20℃沉淀20min。 12.10000g离心10min。 13.倒去无水乙醇,用1ml 70%乙醇洗涤沉淀,10000g离心5min。 14.置冰箱内开盖干燥。悬浮至40μl去离子水或TE中。 六、注意事项 1.所用器具必须严格清洗,最后要用重蒸水冲洗3次,凡可以进行灭菌的试剂与器具都要经过高压蒸汽灭菌,防止其他杂质或酶对 DNA的降解,对 Eppendorf管、Tip与非玻璃离心管等只能湿热消毒,这些塑料制品烤干时,温度不能超过80℃,以免熔化,因此,一般用70℃烘烤。 2.细菌培养容器最好用三角烧瓶,其容量至少应为培养液的四倍,从而保证氧气的供应。 3.在碱裂解提取质粒的方法中,关键步骤之一是加入NaAc的时机,这一步决定了DNA变性与复性的时间。既要使试剂与染色体DNA充分作用使之变性,又要使染色体DNA不裂解成小片段,才能与质粒DNA相分离,这就要求试剂与溶液充分摇匀。 4.加入乙醇沉淀DNA时,要把离心管加盖颠倒摇动4-5次,使水相与乙醇混匀。 5.乙醇沉淀后,乙醇应尽量去除干净,否则既不利于DNA的溶解,又对后面的操作有影响。 思考题 1.有机溶剂抽提为什么可以达到除蛋白、脂类杂质的目的? 2.异丙醇沉淀DNA后为什么要经过70%乙醇清洗这一步? 3.逐步说明强碱法提取质粒DNA的原理。

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